分子杂交基因芯片课件.ppt

第四章 基因操作中大分子的分离和分析;三、分子杂交; Southern杂交： 即DNA-DNA杂交分析，检测样品中特定的DNA及其含量 。 Northern杂交： 即RNA-DNA杂交分析。检测样品中是否含有特定 基因的转录产物（mRNA）及其含量 。 Western杂交： 即利用抗原-抗体反应，检测转移到硝酸纤维素 膜上的特异性蛋白质。 ;Southern杂交 1975年，英国Southern创建 1.是一种检测DNA分子的一种方法，通过southern印迹转移将琼脂糖凝胶上的DNA分子转移到硝酸纤维素滤膜上，然后进行分子杂交，在滤膜上找到与核酸探针有同源序列的DNA分子。;2.主要步骤：;3.Southern 印迹转移（转膜）;;;印迹转移（blotting) ：通过电泳将DNA、RNA或蛋 白质样品进行分离，使不同相对分子质量的的分子 在凝胶上展开，然后将凝胶上的样品通过影印的方 式转移到滤膜上的过程称为印迹。; 4.探针及探针的标记 探针：分子杂交中被标记的已知序列的核酸片断称为探针。 （1）探针的种类： 根据探针的标记物不同：放射性探针和非放射性探针； 根据探针的来源及核酸性质不同：分为DNA探针,RNA探针，cDNA探针，及寡核苷酸探针等几类。 Western杂交中的抗体被看作探针。 ;（2）探针的标记： i）标记物 同位素标记：32P、35S、3H等 非同位素标记：生物素、地高辛、荧光素等 ;ii）标记方法 a 均匀标记 b末端标记 ;a 切口平移法(nick translation)：大肠杆菌的DNA聚合酶Ⅰ b 随机引物法(random primer)：六核苷酸残基的引物 c PCR扩增标记法: d末端标记法: ;;;5ˊ;;;T4-多核苷酸磷酸激酶（T4-PNP）;a. 放射性标记的优缺点：; b.非放射性标记： 地高辛标记 地高辛可以与dNTP连接成地高辛-dUTP( UTP)等，参入DNA(RNA)的合成过程，形成地高辛标记的DNA(RNA)探针。 利用抗地高辛的抗体通过酶联免疫反应来完成。 ;探针检测原理;偶联酶及其底物;AP的显色反应底物;;(4) 单链探针的获取;;;Northern 印迹杂交(Northern bloting);Western杂交;其他分子杂交;;四、基因芯片技术;;6400点的基因芯片 （面积 12X14 mm);基因芯片分析的过程主要包括：样品及其标记处理、芯片制作、分子杂交、信号的检测和数据处理及分析等。;（三）、生物芯片的分类  1．按载体材料不同 ①玻璃芯片 ②硅芯片 ③陶瓷芯片 目前，玻片材料因易得、荧光背景低、应用方便等优点在国际上被广泛接受。通常是将玻片用化学方法处理并连接上活性基团，如氨基、醛基、巯基等，使生物分子通过共价键或离子键与载体结合。 ;2．按点样方式不同  ① 原位合成芯片（Loci-synthetic DNA Chip ②微矩阵芯片（Microarray）③电定位芯片（Microelectronic） 是利用静电吸附的原理将DNA快速定位在硅基 质、导电玻璃上。;3．按芯片固定的生物分子类型 ??? ① 基因芯片或 DNA 芯片 ????② 蛋白质芯片（Protein Chip） ????③ 芯片实验室（Lab-on-Chip） 在微小的硅材料表面，制造出能够对微量样品进行变性、分离、纯化、电泳、PCR扩增、加样及检测等微小结构，使过去一个实验的各个实验步骤微缩于一个芯片上，这种技术被称为芯片实验室。 ;;;4．按芯片使用功能和用途不同分类 ???① 测序芯片 ???② 表达谱芯片 ???③ 基因差异表达分析芯片 ;;基因功能分析研究;（四）、基因芯片技术的特点 高通量、微型化： 基因芯片技术的特点的核心是微型化。芯片每平方厘米固体表面上可固定十万个 DNA 片段、数万个基因。一次分析可得到数万个基因的表达信息。微型化的另一方面是样品用量与试剂用量的微量化，用纳克级的 mRNA 、微升级的杂交液就能分析成 千上万个基因的表达信息。 平行化： 基因芯片技术可在同一张芯片上同时对实验组和对 照材料进行杂交分析，实现了平行化操作，避免了各种 误差，提高了信息的重现性和准确性，使实验结果具有 可比性。 自动化：