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一个Western Blot和DNA电泳定量自动分析系统 　　摘要：针对Western Blot以及DNA电泳等实验研究结果定量分析主要应用凝胶成像系统完成，定量分析软件操作流程繁琐的特点，设计出一个适用于Western Blot及DNA电泳等结果定量分析系统。介绍系统中图像处理的问题：图像二值化、分割与感兴趣区域提取、定量分析中的面积计算，着重从计算机图像处理的角度说明定量分析的解决方案。实验证明，系统能够减少实验员人工干预操作，定量分析结果能够满足Western Blot及DNA电泳等实验研究定量分析的应用需要。 　　关键词: Western Blot; DNA电泳;凝胶成像;图像处理;图像分割 　　中图分类号：TP317文献标识码：A文章编号：1009-3044(2012)17-4222-03 　　An Automated System for the Quantitative Analysis of Western Blot and DNA Gel Electrophoresis 　　QIU Wen-feng1，LI Cai-hong2 　　(1. Department of Information Engineering of Guangdong Medical College，Dongguan 523808,China；2. Department of Biochemistry and Molecular Biology of Guangdong Medical College，Dongguan 523808, China) 　　Abstract：An automated system was designed for the quantitative analysis of western blot and DNA gel electrophoresi, which typically based on Gel Imaging System and complicated to exectue. The problems with image processing, for example the binary transformed from color image, picking up Regin of Interest(ROI) by image segmentationand elementary area etc, were introduced. The solution of these problems would be discussed by image processing. Experiments showed this system could simplify the operation process and satisfy the quantitative analysis requires. 　　Key words：western blot; DNA gel electrophoresis; gelation image; image processing; image segmentation 　　凝胶电泳或称胶体电泳[1]是广泛用于分离不同物理性质分子的技术。凝胶电泳通常用于分析用途，例如蛋白免疫印迹或者DNA测序。其中，蛋白免疫印迹（Western blotting或Immunoblotting）是当前蛋白分析的一种常规技术[2]，通过该技术可以对蛋白进行定性和半定量分析。与Western blotting原理相似的还有Southern于1975年创建的DNA印迹技术（Southern blotting）[3]和RAN印迹技术（Nothern blotting）[4]。这类印迹技术的共同点是使用凝胶电泳技术，最后通过放射自影术（Autoradiograph）[6]得到图像，并采用图像处理技术得到定量分析结果。 　　当前对于放射自影、图像处理和定量分析的方法，可以分为三种方法：1）采用凝胶成像分析系统得到印迹图像，并导入至特定的图像处理系统得到定量分析，例如BIO-RAD公司的Molecular Imager Chemi DoC XRS+影像系统成像通过Quantity one定量分析软件得到定量分析结果[7]；2）采用Photoshop处理，受实验条件限制，对于没有凝胶成像系统设备，实验往往采用压胶片的方式得到图像，由科研人员通过Photoshop手工勾选感兴趣的条带区域，并以矩形近似计算积分光密度值；3）使用开源图像软件ImageJ对压胶片得到图像进行定量分析[8]。 　　方法一依赖昂贵的凝胶成像分析系统，由于自带的图像定量分析软件是封闭的，因此