两个不同品种肉兔TLR4基因多态性的研究.docVIP

两个不同品种肉兔TLR4基因多态性的研究 　　摘要：TLR4能识别内毒素脂多糖（LPS），在介?Ц锢际弦跣跃?及其LPS的宿主反应中发挥重要作用，是研究肉兔抗病力的重要候选基因。为了研究TLR4在不同肉兔品种的突变情况，设计引物对2个不同肉兔品种的12个个体的TLR4部分编码区进行序列扩增，并比较其序列。结果表明，共检测到3个SNP位点，均为非同义突变。2个非同义位点（G628T和C653A）位于预测蛋白的亮氨酸富集区（LRR）区域。LRR区域发生的非同义突变，尤其是亮氨酸的改变和氨基酸极性的改变可能会影响TLR4对病原的识别，这些SNP位点将有助于肉兔抗病分子标记的研究。 　　关键词：肉兔；TLR4基因；单核苷酸突变；非同义突变；抗病力 　　中图分类号：S829.1 文献标识码：A 文章编号：0439-8114（2018）11-0100-03 　　DOI：10.14088/ki.issn0439-8114.2018.11.025 　　Abstract： TLR4 could detect endotoxin by identifying lipopolysaccharide （LPS） and play a key role in host defense mediated by Gram-negative bacteria（LPS），therefore， TLR4 is a significant candidate gene for rabbit diseases resistance research. To identify nucleotide polymorphisms between two different breeds we designed primer pairs that amplified fragments of coding sequence（CDS） of 12 individuals， and compared the sequences. Comparative sequence analysis indicated that 3 SNPs were identified， all were non-synonymous SNPs. Two nonsynonymous SNPs（G628T and A653C） were located in the LRR domains of the predicted protein. The nonsynonymous SNPs in the LRR domains， especially related to leucine residues， may dramatically alter the ability to identified extracellular pathogens. The identification of these polymorphisms reported here increases the resource of genetic markers useful for association analyses with disease resistance and provides an important theoretical basis for disease resistant breeding of meat rabbits. 　　Key words： meat rabbits；TLR4 gene；SNP；nonsynonymous SNPs；disease resistance 　　Toll样受体首次在果蝇的胚胎发育中发现，称dToll。随后陆续发现人与其他哺乳动物存在与Toll类似的一组蛋白，称为Toll样受体[1，2]。Toll样受体广泛分布于机体各组织中，在识别病原相关分子模式中起重要作用，形成机体应对病原入侵的“第一道防线”[3]。TLR4是TLRs家族的重要成员之一，可以识别各种病原微生物成分，诱导机体的天然免疫和获得性免疫反应，TLR4基因变异可影响其受体结合配体的功能及其与配体结合以后的信号转导能力，对机体的病原识别和抗病性能具有重要影响[4]。研究表明，TLR4基因多态性与宿主的炎症应答及对传染性疾病的易感性存在关联[5]。TLR4属于细胞表面TLR，其结构分为胞外区、跨膜区和胞内区3个部分。胞外区有18～31个亮氨酸的重复序列（Leucine-rich repeats，LRRs），胞内区由Tol同源结构域 （Tolhomology domain，TH domain）和Toll样受体/白介素-同源结构域（Toll/L-1-receptor homologous re