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农学专业生物信息学课程教学的改革探析 　　摘要生物信息学是以计算机为媒介,对生物信息进行储存、检索与分析的科学。随着分子生物学的飞速发展,生物信息学在农学等生命科学研究领域的重要性日益显现。分析了农学专业生物信息学课程教学中存在的问题,提出了其改革的思路。 　　关键词农学专业;生物信息学;教学改革;存在问题;思路 　　中图分类号 G642.0 文献标识码A文章编号 1007-5739(2010)05-0015-02 　　 　　生物信息学是生物学与计算机科学交叉的学科,主要是对数据进行储存、提取和分析,是生命科学前沿的研究领域之一。随着基因组学的飞速发展,新方法、新技术不断涌现,生命科学的研究方法与手段也随之发生了革命性的变革。在生命科学研究方法与手段变革的过程中,生物信息学发挥着十分重要的作用[1,2]。农学属于生命科学领域,在农学专业中开设生物信息学课程,不仅有助于培养农学专业学生的科研创新能力,而且能够有力推进生物信息学在农学领域的广泛应用。 　　目前,高等院校开设的生物信息学课程多为公选课,是将不同年级、不同专业的学生安排在一起进行教学,在课堂上教师多半教授一些共性的内容。但学生,尤其是研究生迫切需要学习与自身专业紧密相关的生物信息学知识。因此,根据农学专业的特点,开设农学生物信息学课程十分必要。 　　1农学专业生物信息学课程教学中存在的问题 　　1.1缺少合格师资 　　生物信息学是生物学、计算机科学等多个学科交叉的科学,因此对师资的要求较高。要求授课教师不仅具有计算机、信息科学、数学的学习背景,而且要求具备农学方面的基本理论与知识。现在在农学专业中开设生物信息学课程的教师,有的是计算机专业毕业,他们缺乏生物学学习的经历;有的是农学专业毕业,他们一边学习生物信息学一边授课,处在边学边教的阶段。农学生物信息学合格师资的缺乏影响了课堂教学的整体效果,是农学生物信息学课程改革亟待解决的问题。 　　1.2教材缺乏 　　目前国内的生物信息学教材多为国外教材的影印版或者是国外著作的中文翻译版本,这些教材或者涉及的面较广,对学生的基础要求较高;或者偏重于理论的介绍,缺乏对实践环节的具体讲解。生物信息学是对实验操作技能要求较高的课程,但专门系统介绍生物信息学实验操作技能的中文教材很少。组织人员编写针对农学专业的生物信息学教材,尤其是偏重于系统讲解实验操作技能的教材十分迫切。 　　1.3教学网络资源匮乏 　　随着人们对生物信息学重要性认识的不断提高,国内出现了一些生物信息学教学的网络资源,包括生物信息学的网络版教材(如浙江大学樊龙江博士编写的网络版《生物信息学札记》,截止到2010年1月已经更新到第3版,该教材的网址为:/bioinplant/courses/Bioinformatics_ note_V3.htm)、综合性的生物信息学网站(如北京大学生物信息中心,该中心的网址为:/chinese/)、生物信息学学习与研究论坛(如生物谷的生物信息学论坛,该论坛的网址为/bbs/forum-57-1.html)等[3],但国内生物信息学教学的网络资源还相对匮乏,针对农学生物信息学教学的网络资源更是稀缺。 　　2农学专业生物信息学课程教学改革的思路 　　2.1借助网络资源与多媒体技术,优化教学环境 　　生物信息学是以计算机为核心工具,对生物学数据进行储存、调用与释读的科学。因此,在农学生物信息学课程的教学过程中必须高度重视网络资源与多媒体技术的应用。选择专门的计算机网络实验室作为农学生物信息学课程的授课地点。这样,在课堂教学过程中,师生可以随时在线使用生物信息学数据库,亲自操作相关的生物信息学软件。同时,教师通过制作精美的多媒体课件,可激发学生的学习兴趣与求知欲。如:在讲解蛋白质结构预测的内容时,教师可以在多媒体课件中加入蛋白质三维结构的立体图片,使教学课件图文并茂,让学生获得感性认识。此外,教师可以借助电子邮件E-mail、个人博客、QQ聊天等网络平台,及时了解学生对课堂教学的反馈与建议并改进教学方法,切实提高课堂教学效果。 　　2.2培养学生动手能力,重视实践教学环节 　　生物信息学是一门对实践能力要求很高的课程,因此在教学过程中,要充分发挥学生的主观能动性和创造力,切实提高学生理论应用于实践的技能。在农学专业开设生物信息学课程,其主要目的是让学生掌握生物信息学的基本技能,并将其应用到专业的学习与研究中去。因此,在农学生物信息学课程的讲授过程中,对生物信息学的基本理论作简单介绍后,应结合农学专业的特点,重点讲解生物信息学的基本操作技能,包括与农学专业相关的生物信息学数据库与软件的使用等。教师在每节课示范完成后,让学生亲自动手实践。平时还可以布置一些思考题,让学生独立上机操作完成,从而培养学生的实践操作技