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- 2018-10-26 发布于境外
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GO富集分析 - Jingbo Xia.pdf
GO富集分析
生物信息:付海涛
概览
核酸杂交原理 统计学原理 基因注释
基因芯片数据 RNA的表达量 基因差异表达 基因富集分析
1.质量控制
2.背景校正、标准化
一、基因芯片数据简介
一张基因芯片(以affymetrix表达谱芯片为例)可以包含上万个的探针
(通常由25个碱基组成),他们整齐有序地印刷在芯片上。一组探针或者探
针组(probe set),来自于一个基因,通常由20对或者11对探针组成。
需要强调的是,芯片数据领域提到的基因表达矩阵往往是以探针组而忽
视以基因为单位的,即每行都对应一个探针组的表达量。
差异基因分析也是找打显著性差异的表达的探针组,然后通过ID映射才
对应到探针组代表的基因,探针组与基于的关系往往是多个探针组对应一个
基因。
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