GO富集分析 - Jingbo Xia.pdfVIP

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  • 2018-10-26 发布于境外
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GO富集分析 - Jingbo Xia.pdf

GO富集分析 生物信息:付海涛 概览 核酸杂交原理 统计学原理 基因注释 基因芯片数据 RNA的表达量 基因差异表达 基因富集分析 1.质量控制 2.背景校正、标准化 一、基因芯片数据简介 一张基因芯片(以affymetrix表达谱芯片为例)可以包含上万个的探针 (通常由25个碱基组成),他们整齐有序地印刷在芯片上。一组探针或者探 针组(probe set),来自于一个基因,通常由20对或者11对探针组成。 需要强调的是,芯片数据领域提到的基因表达矩阵往往是以探针组而忽 视以基因为单位的,即每行都对应一个探针组的表达量。 差异基因分析也是找打显著性差异的表达的探针组,然后通过ID映射才 对应到探针组代表的基因,探针组与基于的关系往往是多个探针组对应一个 基因。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

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