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酵母核小体中心序列与连接序列的差异分析-内蒙古大学学报自然
( )
2015年 3月 内蒙古大学学报 自然科学版 Mar. 2015
第 卷第 期 ( )
46 2 JournalofInnerMonoliaUniversit NaturalScienceEdition Vol.46No.2
g y
文章编号: ( ) : /
1000-1638201502-0168-09 DOI10.13484 .nm dxxbzk
j g
酵母核小体中心序列与连接序列的差异分析*
, , , ,
尼玛达瓦 李 宏 周德良 郑 燕 杨小希
( , )
内蒙古大学物理科学与技术学院理论生物学研究室 呼和浩特 010021
摘要: ,
基于 等 年给出的酵母全基因组单碱基精度的核小体定位图谱 从中提取出
Broaard 2012
g
( 、、 )
酵母基因组全部的核小体中心序列和连接序列 计算 取 和 在两类序列中的相
. kmerk 456 8
-
,
对频率 分析两类序列中 的使用差异 按照 相对使用频率对数增序的方式排列模
kmer . kmer
- -
,
体 得到两类序列 相对频率对数比的分布 结果显示模体长度越长两类序列的使用差异越
kmer .
-
, ,
明显 当 以后差异分布逐渐稳定 按照中心序列 相对频率增序的方式排列模体 发现
k7 . 8-mer
,
在相对频率小于 的区域 两类序列的 使用差异显著 分别计算了 个抽样点附近中心
0.5 8-mer . 7
序列偏好的 和连接序列偏好的 的 含量和二核苷含量 结果显示两类序列模
8-mer 8-mer G+C .
, ,
体的 含量随着
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