目标起始密码子多态性（SCoT）一种基于翻译起始位点的.PDFVIP

分子植物育种，2009 年，第7 卷，第3 期，第635-638 页 Molecular Plant Breeding, 2009, Vol.7, No.3, 635-638 新思路、新技术、新方法 Novel Thinking Technology 目标起始密码子多态性(SCoT): 一种基于翻译起始位点的目的基因标记 新技术 1,3 2,3* 3 3 4* 熊发前 唐荣华 陈忠良 潘玲华 庄伟建 1 福建农林大学生命科学学院, 福州, 350002; 2 广西农业科学院经济作物研究所, 南宁, 530007; 3 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室, 南宁, 530007; 4 福建农林大学作物科学学院, 福州, 350002 * 通讯作者, tronghua@163.com; zhuangwj@ 摘 要 随着功能基因组学的发展，分子标记领域已开始从传统的随机或匿名性分子标记转向目的基因标 记和功能性标记。 目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism, SCoT)标记是一种基于翻译起始 位点的目的基因标记新技术，具有操作简单、重复性好等特点，根据ATG 翻译起始位点侧翼保守序列来设计 单引物，扩增产生偏向候选功能基因区显性多态性标记，适合不同层次实验室的不同领域的广泛应用，SCoT 标记已开始在水稻和花生上得到运用。本文旨在介绍给研究者一种可以作为传统的RAPD、ISSR 标记有效补 充的目的基因标记新技术，希望其广泛的应用于生物多样性分析、遗传图谱构建、重要性状标记等方面。 关键词 SCoT 标记技术, 基因目的标记, 功能性标记, 单引物扩增反应 SCoT: A Novel Gene Targeted Marker Technique Based on the Translation Start Codon Xiong Faqian 1,3 Tang Ronghua 2,3* Chen Zhongliang 3 Pan Linghua 3 Zhuang Weijian 4* 1 College of Life Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, 350002; 2 Cash Crops Research Institute, Guangxi Academy of Agricultur- al Sciences, Nanning, 530007; 3 Guangxi Crop Genetic Improvement and Biotechnology Laboratory, Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nan- ning, 530007; 4 College of Crop Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, 350002 * Corresponding authors, tronghua@163.com; zhuangwj@ DOI: 10.3969/mpb.007.000635 Abstract With the development of functional genomics, the area of molecular markers has witnessed a shift from the so-called random DNA markers (RDMs) or anonymous markers to gene-targeted markers (GTMs) and func- tional markers (FMs). Start codon targeted polymorphism (SCoT) is a novel gene targeted marker technique based on the translation start codon with the characteristics of simplicity and reproducibility. The primers for SCoT marker analysis were designed based on the short conserved region surrounding the