湛江官渡近江牡蛎养殖水细菌群落的DGGE指纹分析DGGE.PDF

第 8 卷第 5 期 南 方 水 产 科 学 Vol. 8, No. 5 2 01 2 年 1 0月 South China Fisheries Science Oct. , 2012 doi: 10. 3969/j. issn. 2095 - 0780. 2012. 05. 005 湛江官渡近江牡蛎养殖水细菌群落的 DGGE 指纹分析 1, 2 2 2 2 1 兰 兰 , 刘广锋 , 王江勇 , 王瑞旋 , 刘文生 ( 1. 华南农业大学, 广东 广州 510642; 2. 中国水产科学研究院南海水产研究所, 广东省渔业生态环境重点实验室, 农业部南海渔业资源开发利用重点实验室, 广东 广州 510300) 摘要: 2011 年 3 月 ～12 月利用变性梯度凝胶电泳( denatured gradient gel electrophoresis, DGGE) 技术对湛江官渡地 区近江牡蛎( Crassostrea ariakensis) 养殖水细菌群落组成进行了监测研究。UPGAMA 聚类分析显示 3 月 ～12 月的 样品细菌主要分属 2 大类群; 多样性指数结果显示 3 月 ～7 月细菌多样性高于 8 月 ～12 月; 系统发育分析显示牡 蛎养殖区水体优势菌群主要由以下种群组成: 未可培养的变形菌门( Proteobacteria) ( α、γ、δ、ε) 、未可培养的 拟杆菌门( Bacterioidetes) 、未可培养的疣微菌门 ( Verrucomicrobiae bacterium) 、未可培养的放线菌门 ( Actinobacte- ria) 和未可培养的蓝细菌门( Cyanobacter bacterium) 。最优势菌群为α-变形菌纲和拟杆菌门的黄杆菌属( Flevobacte- rium) 。 关键词: 近江牡蛎; 养殖水; 细菌群落; DGGE 中图分类号: S 917. 1 文献标志码: A 文章编号: 2095 - 0780 - ( 2012) 05 - 0031 - 08 DGGE fingerprinting of bacterial community in aquaculture water of Crassostrea ariakensis from Guandu district, Zhanjiang city 1 , 2 2 2 2 1 LAN Lan , LIU Guangfeng , WANG Jiangyong , WANG Ruixuan , LIU Wensheng ( 1. South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China; 2. Key Lab. of Fishery Ecology an