北极狐CETP基因序列扩增及结构特征分析.PDFVIP

中国农学通报 2012,28(23):73-79 Chinese Agricultural Science Bulletin 北极狐CETP基因序列扩增及结构特征分析 1 2 张 敏 ，白秀娟 1 2 （辽宁医学院锦州畜牧兽医学院，辽宁锦州121001；东北农业大学动物科技学院，哈尔滨150030） 摘 要：为了研究北极狐胆固醇酯转运蛋白基因(CETP) 的结构特征，找到影响北极狐体形、体重的重要 基因，以达到提高北极狐毛皮质量。对北极狐CETP 基因序列扩增后得到的序列结构数据，利用 SignalP 3.0 Server、ClustalX1.83、Mega 4.0、Promoter predictions 、TMHM 2.0 等生物学软件进行分析，获 得了它的序列特征，并对其结构和功能进行了预测。结果表明：北极狐与犬的遗传距离是0.015 为最近， 与鼠的遗传距离是最远的，北极狐的胆固醇酯转运蛋白是一个分泌蛋白，主要是进行O 糖基化修饰，蛋 白的二级结构结果：α螺旋占34.87% ，β转角占，18.97% ，无规则蜷曲占46.15% 。北极狐CETP 基因是参 与北极狐生产性能调控的重要候选基因。 关键词：北极狐；CETP 基因；结构特征 中图分类号：S815.6 文献标志码：A 论文编号：2012-1736 AnalysisofArcticFoxsCETPGeneOrderAugmentationandStructureCharacteristics 1 2 Zhang Min , Bai Xiujuan 1 ( CollegeofAnimalHusbandryandVeterinaryMedicine,LiaoningMedicalCollege, Jinzhou Liaoning 121001; 2 CollegeofAnimalScienceandTechnology,NortheastAgriculturalUniversity, Harbin 150030) Abstract: To study the CETP gene structural features, we could found the important gene that impacts the Arctic foxs body and weight and purpose of improve the quality of the Arctic fox fur. By the Arctic fox cholesteryl ester transfer protein gene amplification and sequencing data, Signal P3.0 and other biological to complete the analysis; by the bioinformatics analysis of the Arctic fox cholesterol ester transfer protein gene, we got its sequence features, and we also predicted its structure and function prediction. The results showed that the distance between Arctic foxs genetic an