第十章药物军生物信息学.pptVIP

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第十章药物军生物信息学

2. 基因多态性及表达水平多态性与药效 大多数要通过蛋白质入受体、细胞信号、酶等其作用,编码这些蛋白基因的多态性,影响个体对药物的敏感性 5-LO是抗哮喘药物的作用靶点,具有基因上的多态性,有的表现型对抑制剂ABT-761就无效 3. 基因的多态性与微生物的抗药性 许多药物由于长期使用而导致疗效下降是临床上常见的问题 和病原微生物抗药性的形成密切相关 如在疟原虫抗氯喹(抗疟疾特效药)的研究中发现,有两个基因的多态性起主要影响作用 4. 基因多态性和群体 许多多态性基因在群体中的频率与人种或种族的特异性有关 这方面的信息对个性化用药以及针对独立群体进行合理药物设计具有重大影响,因而也成为药物基因组学研究的一个方面 6-磷酸脱氢酶缺陷的多态性主要影响了非洲、亚洲、地中海人种的男性对许多药物的敏感以及日本人对酒精的敏感性 三、药物基因组学研究的应用前景 1. 为药物研发开辟了一个全新的领域 随着人类基因组计划的完成,功能基因组计划进展,使以基因治疗为基础的药物发现和开发进入了一个新的历史时期 2. 合理用药与个性化治疗 基因的多态性决定了病人对药物反应的不同,根据病人的基因组特征给药就是个体化给药的治疗方案,是合理用药的核心 个体对药物代谢存在差异,但现代医学实践中采取的仍然是标准体重作为给药剂量的依据,不可避免地存在一些缺陷 今后将根据个体的基因型选择药物和给药剂量,从根本上改变药物治疗模式,实现个体化医疗 3. 巨大的商业机会 挽救副作用较大的药物。诺华公司的精神分裂症药物氯氮平,目前仍是精神病的首选药,但约1%的病人用后会引起危及生命的粒细胞缺乏症,从而限制了市场,如果能检测出粒细胞缺乏症的药物应答基因,无疑会大大拓宽市场 药物基因组能提供药物的应答基因,以此为基础开发出诊断试剂盒 从I期临床开始收集药物应答基因的数据,III期确定使用病人范围,增加药物上市的机会 1998年和2005年药物基因组产品和服务市场 (百万美元) 适应证 1998年 2005年 心血管疾病 8.2 139.1 传染病 7.3 123.3 中枢神经系统疾病 4.3 72.30 癌症 2.4 41.30 其他 24.8 419.0 合计 47.0 795.0 4. 中医药现代化的研究 中医的因人而异的整体治疗方案,正好和个性化的治疗相吻合,目前虽然没有确切证据,但是用药物基因组来解释中医药理论,还是一项具有理论和实践价值的工作 六、dbEST 是EST数据库 网址是:/dbEST 七、TRANSFAC 关于转录因子及其结合位点的数据库 网址为:http://transfac.gdf.de/Transfac 八、TRRD 真核生物转录调控数据库 网址:www.bionet.nsc.ru/trrd 九、 COMPEL 此数据库收集了脊椎动物在转录调节区的调节元件信息 网址:www.gene-regulation. 十、 CUTG 密码子使用频度表(CUTG),是通过Genbank中DNA序列统计出来的 网址:www.kazusa.or.jp/codon 第四节 蛋白质序列数据库 一、SWISS-PROT数据库 该数据库力图提供高水平的数据注释信息,包括对蛋白质功能、结构域的结构、蛋白质翻译后的修饰、突变体的描述。其目标是提供禁垦恩更详尽的、很少冗余的数据,而且数据库中的连接可以直结链接到其它资源上 数据库的网址为: www.ebi.ac.uk/swissprot。 二、PIR数据库 PIR是国际上最大的公共蛋白质序列数据库,是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库。所有的序列都经过整理,超过99%的序列已经按蛋白质家族分类,一半以上还按蛋白质超家族进行了分类 数据库网址为: 三、PROSITE数据库 收集了生物学有显著意义的蛋白质位点和序列模式,并能根据这些位点和模式快速可靠地鉴别一个未知功能蛋白的蛋白序列应该属于哪一个蛋白家族 网址为:www.expasy.ch/prosite 四、PRINTS数据库 是建立在蛋白质指纹技术之上的数据库。蛋白质序列指纹图

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