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菜鸟首作——如何用brainnetviewer作出离散数据的脑图
菜鸟首作——如何用brainnet viewer 作出离散数据的脑图
在大部分时候,我们利用已经存在的colorbar 来作图,若遇到把统计的离散值存
入nifti 数据里,需要可视化并选择我们喜欢的颜色来做脑图时,我个人知道的就是使
用brainnet viewer。
1.下载并安装brainnet viewer 请参照网页/projects/bnv/。
2.在matlab 的命令窗口输入BrainNet。
3.fileload file ,我的数据是基于volume 上的离散数据。
点击ok 。
4.选择自己需要的layout,默认参数是single view ,我选择full view.
然后点击volume ,在下图colormap 处调成custom ,随后弹出另一个页面。根据英文
提示input a n*3 matrix (n 为离散的数值个数,3 为每个颜色的RGB/255 的值,这里是
因为manual 里提到为0~1 的数字,因此需要用matlab 转换一下颜色的RGB 值)。有
很多提供不同颜色以及配色的网站,例如:
.hk/rgb.htm
/rgb.htm
小清新。。。/archives/28884.html
姨妈色配图。。。。。。下图我填入的矩阵格式如下,一定要注意分号和中括号的格
式,如果apply 后不出图,基本上是颜色的格式写错啦。数据的数值范围是1~7,null
值也可以做相应的设定。
[1 1 1;
1 0.6275 0.4784;
1 0.447058823529412 0.337254901960784;
0.933333333333333 0 0;
0.803921568627451 0 0;
0.545098039215686 0 0;
0.3 0 0;]
Ps:一般画一次图后就会卡死,需要再打开一下才能修改参数,真的很崩溃,如果有更
好的画离散数据的方法,请赐教!
这个问题的解决办法是点file 然后重新操作一遍,千万不要直接改参数。然后win 的
使用感受好于mac。
高大苕
gaojq@
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