真核基因表达调3.pptVIP

谨慎理解锌指存在的意义： 尤其是蛋白质仅含有单个锌指时。锌指可能参与RNA的结合而不是DNA结合，或它与任何核酸结合活性均无关。 (3) 碱性-亮氨酸拉链(basic - leucine zipper, bZIP) 这种基序含4-8个亮氨酸，每隔6个氨基酸就有一个亮氨酸残基间隔，这导致第7个亮氨酸残基都在螺旋的同侧。又因这类蛋白质都以二聚体形式与DNA结合，两个蛋白质α螺旋上的亮氨酸靠近而形成拉链样结构。 The basic regions of the bZIP motif are held together by the dimerization at the adjacent zipper region when the hydrophobic faces of two leucine zippers interact in parallel orientation. N-end （4）螺旋-环-螺旋 (helix-loop-helix, HLH) ◆ 螺旋-环-螺旋蛋白质有一个由40-50个氨基酸残基组成的基序，含有两个两性α螺旋。 ◆ α螺旋由15-16个氨基酸残基组成，两个α螺旋被环隔开。 ◆ 螺旋负责二聚体的形成，bHLH蛋白含碱性序列，它在HLH基序附近，负责结合DNA。 An HLH dimer in which both subunits are of the bHLH type can bind DNA, but a dimer in which one subunit lacks the basic region cannot bind DNA. An HLH dimer in which both subunits are of the bHLH type can bind DNA, but a dimer in which one subunit lacks the basic region cannot bind DNA. 3.2.5 反式作用因子中的转录激活域 (Transcriptional activation domain) （1）酸性激活域 （2）富含谷氨酰胺的激活域 （3）富含脯氨酸的激活域 酸性激活域 acidic activation domain 共同点：它们之间并不存在较为明显的氨基酸序列的同源性，但却都含有高比例的酸性氨基酸，产生出很强的净负电荷。 例如：糖皮质激素受体蛋白质17/82；GCN4为17/60 。 （2）富含谷氨酰胺的激活域glutamine-rich activation domain 例：在组成型表达的转录因子SP1的两个最强的激活域中，谷氨酰胺几乎占了25%，而带负电菏的氨基酸比例则非常低。 （3）富含脯氨酸的激活域proline-rich activation domain 与CCAAT元件结合的组成型转录因子CTF/NF1，转录激活域位于转录因子的C-末端，其中酸性氨基酸及谷氨酰胺所占比例都很低，但含大量的脯氨酸，约占该区域的1/4。 如原癌基因蛋白质产物Jun和AP2以及Oct-2中，都鉴定出了富含脯氨酸的激活域。 3.3 真核基因转录调控的模式 3.3.1 RNA聚合酶Ⅰ的启动子和转录因子 3.3.2 RNA聚合酶Ⅲ的启动子和转录因子 3.3.3 RNA聚合酶 Ⅱ的启动子和转录因子 酶 主要转录产物 RNA聚合酶Ⅰ rRNA，大多数snRNA RNA聚合酶Ⅱ mRNA前体，部分snRNA RNA聚合酶Ⅲ tRNA、部分snRNA 真核细胞细胞核中共有3类RNA聚合酶 RNA聚合酶Ⅰ的启动子由一个核心启动子 (core promoter) 和一个上游控制元件 (upstream control element, UCE) 组成。 3.3.1 RNA聚合酶Ⅰ的启动子和转录因子 Transcription units for RNA polymerase I have a core promoter separated by ~70 bp from the upstream promoter element. UBF binding to the UPE increases the ability of core-binding factor to bind to the core promoter. Core-binding factor positions RNA polymerase I at the startpoint. UBF SL1 (-45~+20) (-180~-107) 3.3.2 RNA聚合酶Ⅲ的启动子和转录因子 RNA聚