变应性鼻炎及其合并哮喘者差异基因表达谱的研究耳鼻咽喉头颈外科学专业论文.docxVIP

山西医科大学博士学位论文测到40--50％基因是有表达的，表明芯片检测的灵敏度很高。Signal 山西医科大学博士学位论文 测到40--50％基因是有表达的，表明芯片检测的灵敏度很高。Signal Log Ratio栏中的值≥1 或≤一l，代表信号强度之间的差异至少2倍。本研究设定差异至少2倍以上有意义，可得差异 表达的基因共有1900个，其中有849个基因，表达上调，1051个表达下调。 =对s根极其SAR合并哮喘者差异基因行分子生物信息学分析 3．$AR及其合并哮喘者差异基因的∞功能分类和生物通路(pathway)分析 利用GeneSpring软件，依据Gene Ontology数据库对AR及其合并哮喘者的2倍以上、4 倍以上差异表达基因进行GO分类：依据KECK；数据库、GenMapp数据库分别对2倍以上差 异基因及差异最显著的前十个基因行生物通路pathway分析。结果显示2倍以上差异基因基 因主要与细胞代谢、基因转录、细胞增殖、信号转导、免疫应答、多种酶活性、膜受体结 合活性、细胞结构蛋白活性等相关；根据KEGG数据库对差异表达2倍以上的基因分析其生 物通路(pathway)分析得到：1900个基因分成161类，其中，包含20个以上基因的种类有： 参与细胞因子受体间相互作用基因有40个、局部黏附基因28个，细胞黏附分子26个，参与 细胞骨架肌动蛋白调节的基因26个，参与细胞间信号传递基因24个，缝隙连接相关基因23 个，参与促分裂原活化蛋白激酶信号传导通路基因23个，钙相关信号传导通路23个，白细 胞跨膜转运相关基因21个，参与嘌呤代谢基因20个。在所有pathway中，最为引人的是炎症 反应途径(Hs—Inflammatory_Response_Pathway)；在对上调、下降表达差异最大的十个基 因分析得出：两下调基因TEKTl(SLR=．7．2，即130多倍)、AKAPl4(SLR=-6．7，即100多倍) 均与鼻黏膜纤毛活性、运动相关；RAFl参与丝裂原活化蛋白激酶(MAPK signalingpathway) 信号传导通路。 4．鼻黏膜SCCAl、SCCA2表达水平有望成为变应性鼻炎并发哮喘的相关生物标记 对差异表达基因结合GeneCard数据库、pubmed．NLM文献数据库进行数据挖掘(data rating)。结果显示在GeneCard数据库中查到与哮喘相关基因354个，变应性鼻炎相关基因 45个，变应性哮喘(allergic asthma)相关基因13个，结合芯片差异表达基因和pubmed-NLM 文献数据库示鳞状上皮细胞癌抗原SCCAl(SERPINB3)、SCCA2(sERPD姻4)表达升高 与SAR并发哮喘相关。 以上研究结果表明SAR合并哮喘的发生和发展，存在多基因表达调控的改变，对其差 异基因表达谱的研究有助于阐明变应性鼻炎合并哮喘的发生发展机制，并有利于发现一些 未知的与新基因功能潜在相关的信号通路，另外对成人SAR和SAR合并哮喘者的差异基因 表达谱的构建以及相关信号传导通路的逐渐明晰，为成人SAR与SAR合并哮喘基因表达数 据库和AR相关疾病基因网络学说的建立提供了重要的数据． 评估基因芯片检测结果的可靠性及其价值，除了从靶样品的质量与数量、芯片检测与 验证技术、数据挖掘策略与方法三个方面来考察，还应充分考虑基因表达的选择性、时空 性和非最终性。因为。mRNA的表达水平并不完全等同于蛋白质的表达水平(蛋白质表达水 平也只是代表蛋白质的存在及其量的差异)，基因表达的最终结果要看其编码的蛋白质的功 能状态。总之，对mRNA水平的表达差异应有全面、合理、客观的认识和解释。本研究的 II 山西医科大学博士学位论文一些结果还需大样本、多水平的临床验证。 山西医科大学博士学位论文 一些结果还需大样本、多水平的临床验证。 关键词变应性鼻炎变应性哮喘寡核苷酸微阵列分析基因表达谱数据挖掘 1II 山西医科大学博士学位论文The 山西医科大学博士学位论文 The Differential Gene Expression Profile of Allergic Rhinitis(AR)and AR with Asthlna abstract The prevalence of allergic disorders such as allergic rhinitis(AR)has increased so drastically OVer the past two-three decades accompanied by growth of medical science and economic development throughout the world．AR has been a glob