稳态一维和瞬态二维红外光谱揭示淀粉样β蛋白质片段的多态混存聚集过程.PDF

2013 年 第 58 卷 第 26 期：2707 ~ 2710 《中国科学》杂志社 快 讯 SCIENCE CHINA PRESS 稳态一维和瞬态二维红外光谱揭示淀粉样β蛋白质 片段的多态混存聚集过程 郭扬眉, 杨帆, 王建平* 中国科学院化学研究所, 北京分子科学国家实验室, 分子反应动力学实验室, 北京 100190 * 联系人, E-mail: jwang@ 2013-05-06 收稿, 2013-06-27 接受, 2013-07-26 网络版发表 国家自然科学基金和中国科学院“百人计划”资助 摘要 利用傅立叶红外(FTIR)和飞秒二维红外(2D IR)光谱手段, 以位于肽链骨架上的酰胺-I 关键词 带为结构探针, 跟踪研究了淀粉样β体1~25 氨基酸残基片段(Aβ1~25)在酸性条件下的聚集过程. 蛋白质聚集 通过对其在不同聚集阶段的多肽构象及聚集结构动力学的考察, 发现在此条件下 Aβ1~25 片段 二维红外光谱 聚集过程中存在不同聚集程度的聚集体, 也存在一定量的无规则卷曲. 聚集的初态和终态具 淀粉样纤维 有可测量的IR 光谱指纹, 特别是2D IR 光谱指纹, 从对角峰的非均匀和均匀展宽贡献、节线 取向、非对角峰的布局等方面都能表现出来. 讨论了聚集体中酰胺单元之间、多肽质骨架之间 及其和溶剂分子之间的动态相互作用. 在蛋白质折叠过程中, 如果保护 镜[7]等手段的报道. 而振动光谱手段, 是分子局域结构相关性的变化、振动 机制发生障碍, 蛋白质就有可能发生 如红外光谱、拉曼光谱和圆二色光谱 能量传递以及不同物种间的化学交换 聚集, 从而导致疾病[1]. 目前已发现约 等, 对分子结构非常敏感, 也是研究 等信息[9,10]. 因此, 人们期待一维和二 有 20 种蛋白质能发生病理性的聚集. 蛋白质聚集结构的有效手段. 这些手 维红外研究能为阐明分子聚集过程和 实验证明, 淀粉样 β 蛋白质(amyloid-β 段的综合应用, 为阐述蛋白质的聚集 机理提供重要的结构依据. 近年来, protein, Aβ)与阿尔兹海默氏症和帕金 机理和过程奠定了基础. 本文采用稳 用 2D IR 光谱技术研究蛋白质聚集体 森症有关; 胰岛淀粉样多肽(islet am- 态一维红外光谱(FTIR)和飞秒二维红 的实验和理论研究已取得了一些引人 yloid polypeptide)与 II 型糖尿病有关; 外(two-dimensional infrared spectros- 注目的进展[11~23], 如发现了位于 β-片 [12] 而 γD- 晶体蛋白(γD-crystallin) 的聚集 copy, 2D IR)光谱手段, 后者能在化学 层之间的动态水分子等 . 则和白内障有关[2,3]. 一般认为 β-折叠 键的水平上以飞秒时间分辨率跟踪凝 位于蛋白质骨架上的酰胺基团, 是蛋白质聚集体的主要结构形式. 肽 聚相分子体系的结构动力学[8]. 与 2D 在中红外波段有一个强吸收峰, 即通 链之间通过酰胺基团的氢键作用和侧 核磁共振(NMR)谱类似, 在一张2D IR 常所说的酰胺-I 带振动, 其本质是以 链的憎水作用, 形成平行或反平行的 光谱中, 有一系列振动频率不同的对 C=O 伸缩振动为主的肽链骨架局部离 [4~6] 折叠, 逐步形成宏观的纤维结构 . 角峰和非对角峰.