幽门螺杆菌Cag睵AI hp0523基因的克隆及功能预测.doc

PAGE PAGE 1 幽门螺杆菌Cag睵AIhp0523基因的克隆及功能预测 【摘要】目的：明确幽门螺杆菌Cag睵AIhp0523基因的功能，探讨其在幽门螺杆菌致病中的作用。方法：设计引物，以幽门螺杆菌NCTC11637为模板，采用聚合酶链反应（PCR）扩增获得目的片段；将其进行T睞克隆后，进行测序。将该基因序列与其他菌株做BLAST比对分析，并结合生物信息学数据库和软件，分析其序列特征和理化特性。结果：经酶切，测序分析表明，插入的基因片断为510bp，与基因库公布的幽门螺杆菌26695及J99序列相比较，同源性高达94%；软件预测其编码的蛋白为169个氨基酸，其相对分子质量约为19.7kDa，等电点约为9.53；基序分析表明，在33～165位氨基酸之间存在一个保守的SLT催化基序，可能是溶菌糖基转移酶；对其催化能力进行预测，结果表明，HP0523（33.7%）催化能力可能较T4溶菌酶（32.3%）和溶菌酶SLT70（28.6%）的活性高。结论：成功克隆了幽门螺杆菌Cag睵AI的hp0523基因，对其序列进行了深入分析，为进一步研究其功能，阐明幽门螺杆菌Cag睵AI的致病机制奠定了基础。 【关键词】幽门螺杆菌；Cag致病岛；功能预测；溶菌糖基转移酶 Cloningandfunctionalpredictionofhp0523genefrom Cag睵AIinHelicobacterpylori SHAOShi瞙e1,ZHONGQiao1,HUANGShi瞭eng1,HANJun2,HUANGHe2，TIANShu瞱ei2 (1.DepartmentofMicrobiology,SchoolofMedicalScienceandLaboratoryMedicine,JiangsuUniversity；2.InstituteforLifeSciencesofJiangsuUniversity,ZhenjiangJiangsu212013,China) ［Abstract］Objective:Toanalyzethefunctionandtheroleofhp0523geneinHelicobacterpylori(H.pylori)Cag睵AIforpathogenicity;Methods：Polymerasechainreaction(PCR)wasusedtoamplifythehp0523genefromH.pyloriNCTC11637,andthenclonedintothepGEM睺瞖asyplasmidandsequenced.Usethebio瞚nformationdatabasesandtoolstoanalyzetheinformationandpropertiesofthetargetsequence.Results：Sequenceanalysissuggeststhatthisfragmentwith510bpandencoded169aawhichexperiencesarelativemolecularweightat19.7kDaandisoionicpointwasat9.53.Theidentityofthisgenewas94%approximatelyinH.pyloristrains26695andJ99.Motifanalysissuggeststhatitmaybelytictransglycosylase,whichharboredaconservedcatalysisdomainbetween33to165sitesinthetargetsequence.Fromthegeneralacid瞓asecatalysispotentialsuggestthatHP0523(33.7%)withahighercatalysisactivitythanT4lysozyme(32.3%)andSLT70(28.6%).Conclusion：Thehp0523genewasclonedfromH.pyloriNCTC11637successfully,andprovideasolidbasefortheresearchonthepathogenicitymechanismofH.pyloriCag睵AI. ［Keywords］Helicobacterpylori；Cagpahogenicityisland；functionalprediction；lytictransglycosylase 幽门螺杆菌（Helicobacterpylori,H.pylori）是重要的胃肠道致病菌，其感染在世界范围内流行，全球感染率达50％以上，其中包括我国在内的发展中国家感染率高达80％以上，