植检委建议高通量测序技术用作植物检疫诊断工具状态框背景植物.PDFVIP

植检委建议：高通量测序技术用作植物检疫诊断工具 状态框 本部分不是植检委建议的正式内容，在建议获得通过之后，国际植保公约秘书处将作修改。 文件日期 2018 年12 月6 日 文件类型 植检委建议草案 文件当前阶段 提交植检委第十四届会议（2019 年） 主要阶段 2018 年3 月澳大利亚、欧地植保组织和新西兰提议将题为 “下一代测序技术 用作植物检疫诊断工具”的主题纳入 《国际植保公约》工作计划，作为一项 植检委建议。 2018 年4 月植检委第十三届会议将该主题加入 《国际植保公约》工作计划， 作为植检委建议。 2018 年5 月植检委第十三届会议结束以后调整。 2018 年5 月磋商（2018 年5 月15 日-8 月15 日）。 2018 年9 月磋商结束以后修订。 2018 年10 月植检委主席团审议。 2018 年12 月植检委主席团审议。 说 明 本文件为草稿，仅以英文提交磋商。 2018 年8 月根据磋商结果，修改标题（“下一代测序”改为“高通量测序”）。 2018 年10 月编辑。 2018 年12 月编辑（部分）。 背景 植物检疫措施委员会（植检委）承认，准确而迅速的有害生物诊断，为出口 1 认证、进口检验和应用适当植物检疫措施奠定基础 。普遍认为，检测和鉴定植物 有害生物的能力，因检测工具的准确性、重现性和特异性而异。 高通量测序技术，又称下一代测序或深度测序技术，是一种强大的工具，可以 替代传统的诊断方法，用于检测和鉴定生物（例如细菌、真菌、植原体、病毒和 类病毒）。不过，高通量测序的诊断结果可能无法证明携带活体有害生物，也无法 证明这类生物对植物或植物产品有害。因此，在检测和鉴定有害生物方面，应谨慎 解释高通量测序之类高灵敏度技术的结果。特别是在采取植物检疫措施时，应充分 考虑应用高通量测序诊断结果带来的风险和后果。此外，由于平台成本和其他运营 费用较高，高通量测序技术可能不适合所有国家植物保护机构（国家植保机构）。 也应注意到，每家国家植保机构可能采用不同的高通量测序平台。 高通量测序技术的介绍详见附录 1。 1 另见植检委建议R-07 ：有害生物诊断的重要性（/en/publications/84234/ ） 建议的对象 缔约方和区域植物保护组织。 建议的内容 植检委注意到当前面临挑战，同时有必要继续开展工作，利用高通量测序技术 进行有害生物的检测和鉴定，为应用植物检疫规定提供依据。有必要进一步调查 某种未知微生物的高通量测序技术诊断结果，以便证实该微生物是否可能为有害 生物，并可以视作限定性有害生物。 鉴于有缔约方提议，利用高通量测序技术及其结果，作为适当植物检疫规定的 依据，植检委鼓励缔约方： (a) 制定准则，说明在检测出植物材料中未知生物（例如真菌、细菌或病毒）或 无活性生物后，应采取哪些行动； (b) 确保安排到位适当的信息技术和生物信息学基础设施和投资，以及生物信息学 教育培训，以便保障数据的适当存储和测试结果的适当解释，并确保这种技术 得到有效实施； (c) 统一应用高通量测序方面的最佳实践操作准则，包括适当解释结果和采取质量 控制措施（例如程序控制），确保高通量测序数据的输出可靠精确，在植物 检疫中有生物学意义，得到协调一致的实施； (d) 验证高通量测序的可靠性和准确性，为此试验比较高通量测序与其他现有诊断 平台； (e) 向出口国国家植保机构通报高通量测序结果的解释信息，特别是有关检测到的 生物植物检疫风险的结论； (f) 实施高通量测序培训计划，包括在网上开办实验室最佳做法课程，并协调国际 能力测试，对实验室能力进行独立评估； (g) 发布高通量测序规程（针对相应高通