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几种红树植物的遗传变异和抗盐特性的分子生态学研究
几种红树植物的遗传变异和抗盐特性
的分子生态学研究
周涵韬
(厦门大学生命科学学院,厦门361005)
中文攮要
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红树林(Mangroves)是生长于热带、亚热带陆海交汇的海湾河口潮问带的盐生木 本植物群落,它蕴藏着丰富的动植物、微生物基因库,是一种珍贵的生物资源。红树林在 维护海岸生态平衡;防风减灾、护堤保岸;环境污染监铡、挣化与防治等上发挥重要的作 用。目前国内外对红树植物开展了大量的生物学研究工作,成果多集中在生态学,生理学。生 物化学等领域,而分子生物学领域的研究工作还处于起步阶段。本文运用RAPD分子标记 技术,对不同种属红树植物的遗传变异与生态分化进行了研究;首次运用改进的 mRNA差别显示技术,从抗盐能力强的泌盐红树植物一白骨壤基因组中分离克隆了抗
1.采用改良的CTAB抽提方法,成功地从不同种属红树植物的叶片中提取和纯化 了基因组DNA。获得的DNA纯度较好(^m/^2。o在1.6-i.8之间),得率高(平均得率 约为120u gDNA/g F.w.),片段完整(片段大小约为23Kb左右)。适宜于进行PCR扩 增及后续分子生物学研究.说明本文首次在前人工作基础上加以改进的CTAB法,广
泛适用于富含单宁、多糖、脂类、胶质类物质等的红树植物基因组DNA的提取与纯
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化。
RAPD扩增反应的稳定性、重复性及扩增带型的丰富性是进行红树植物遗传多样 性分析的基础.使用德国Biometra公司T3型PCR仪,规范实验操作,采用如下反应 体系:tommol/L Tris-HCI,pH8.0,50mmol/L KCl,O.01%明胶,80rig模板DNA, 2mmol/L MgCl2。0.2mmoi/L dNTPs,0.2 p mol/L 10核苷酸随机引物,0.5U Taq DNA聚合酶,总体积25uL。扩增程序为:94ac变性1ram,360c退火Imin,720c延 伸2rain,共进行40个循环,最后72。C延伸7rain。获得的RAPD扩增结果稳定性 高,重复性好,扩增带型丰富平均为6--7条.
2.以福建九龙江口龙海红树林自然保护区浮宫种苗园内白骨壤(Avicennia marina)、桐花树(Aegiceras corniculatum)、无瓣海桑(Sonneratia apeta]a)、 秋茄(Kandella cande∥、木横(Bruguiera gymnorrhlza)、海莲(Bruguiera sexangu]a)、尖瓣海莲(Bruguiera sezangu]a var.ghynchopeta]a)等7种红树植 物为材料,运用RAPD技术对这7种红树植物进行了遗传多样性分析.从30个lO核苷 酸随机引物中筛选出15个有效引物.利用这15个有效引物共扩增出630条DNA带, 其中多态性条带535,占总扩增条带的84.92%.利用Nei指数法得出7种红树植物问
的遗传一致度和遗传距离,并运用UPGMA统计分析法对红树植物的7个种间的亲缘关
的遗传一致度和遗传距离,并运用UPGMA统计分析法对红树植物的7个种间的亲缘关 系进行聚类分析,DNA分子分类系统图。7个种分为A、B两个大组,A组中包含三个 种,B组中包含四个种。白骨壤(马鞭草科)、桐花树(紫金牛科)、无瓣海桑(海桑科) 同属于A组。白骨壤与桐花树的遗传距离为0.58而与无瓣海桑的遗传距离为0.60, 无瓣海桑与桐花树的遗传距离达0.67。可见这三种红树植物虽然聚类在同一组。但由 于彼此之间的遗传距离较远(qz均0.63),符合传统形态分类,三种红树植物属于不同 科;而同属红树科的秋茄、木榄、海莲、尖瓣海莲经分子聚类一起出现在B组,它们 的平均遗传距离为0.35,分子分类也表明它们聚类为同一科,属于科内属种间关系。 相对于秋茄而言,木榄、海莲和尖瓣海莲这三者的亲缘关系更近,平均遗传距离为 0.28,属于属内种问关系。这和传统的分类学相吻合。由此表明RAPD分子标记技术能 较为客观地反应出红树植物的遗传多样性及其相互间的亲缘关系。
3.进一步以海南东寨港红树林自然保护区中,红树(肋izophora apiculata)、 红海榄(Rhizophora stylosa)、秋茄(Kandelia candeD、角果木(Ceriops tagal)、木揽(BruguJera gy=norrhlza)、海莲(Bruguiera sexangula)、尖瓣海 莲(Bruguiera sexangu]a vsr.rhynchopeta]a)等红树科7种红树植物为材料,通 过已筛选出的15个有效引物进行RAPD分析,获得了红树科7种红树植物的遗传分类 关系。15个有效引物共扩增出617条DNA带,其中多态
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