计算机在化学中的应用-chemdaw专讲.ppt

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计算机在化学中的应用 ——ChemDraw专讲 化学分子结构式的绘图 绘制2D 分子结构的软件: ChemWindow, CS ChemDraw, ISIS Draw 和ChemSketch 等 绘制3D分子结构的软件:CS Chem3D, HyperChem, WebLab ViewerPro, ArgusLab 和RasMol等。(CS Chem3D 和HyperChem 还集成了分子力学、分子动力学、半经验以及从头算量子化学计算的部分) 主要内容 ChemDraw简介 示例练习 化学结构的绘制 文本说明及原子标记 轨道、符号、箭头、弧等 高级绘图技巧 ChemDraw在线信息 ChemDraw简介 “键+单击”:按下特殊的键和单击鼠标键同时进行。如,“Shift+单击”意思是按下”Shift”键和单击鼠标键; “键+拖动”:按下特殊的键和鼠标键,移动鼠标。如,“Shift+拖动”意思是按下”Shift”键和拖动鼠标光标。 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 ChemDraw简介 文件格式介绍 文件格式介绍 文件格式介绍 文件格式介绍 示例1——反应方程式 示例2——绘制中间体结构 示例3——复杂环结构 示例4—Fischer葡萄糖结构 示例5——透视图形 示例6——Newman结构 示例7——立体化学 化学结构的绘制 化学结构的绘制 文本说明及原子标记 原子标记 原子标记 键编辑 化学命名限制 多于一桥以上的桥环(如:三环) 自由基 非标准价态化合物 螺环体系 含同位素的化合物 聚合物 生物分子 轨道、符号、箭头、弧等 轨道工具 化学符号 箭头工具 箭头的使用 指示电荷转移 绘图元素、基元及弧 多中心结构 二茂铁 结构的展开与调整 结构的展开与调整 结构整理要点 结构整理要点 检查化学结构的信息 分析结果窗口 结果粘贴 名称、结构的相互转化 预测结果 不定结构的连接 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 编号显示 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 ChemDraw在线信息 文献全文HTML格式 ChemDraw在线信息 文献全文PDF格式 作业1 作业2 作业3 二茂铁 作业4 绘制减压蒸馏装置图 《结构化学第二版》P255图5.14;图5.15和P257图5.17 (即乙烯加氢反应;丁二烯和乙烯环加成生成环己烯的反应和丁二烯与环丁烯的分子轨道图) 指示键角键长 预测结果 预测结果 预测结果 快捷键 命令 灰色表示命令未激活 小三角 表示 子菜单 省略号表示新对话框 1 CD Template(*.ctp, *.ctr)——用于保存模板文档 2 ChemDraw (*.cdx)——ChemDraw原本格式,是一个公共标记 的文件格式,易被其它程序建立和解释 3 ChemDraw Steyl Sheet(*.cds)——用于存储文件设置和其它物体 4 Connection Table(*.ct)——一种实例格式,存储关于原子与元素、 系列编号、X和Y轴、键序、键类型等的连接和联系的列表。是 用于多类应用程序间互换信息的通用格式 5 DARC-F1 (*.fld)——Questel DARC系统中存储结构的原本文件 格式 7 ISIS Reaction(*.rxn)——MDL开发的格式,用于存储元素反应信息 8 ISIS Sketch(*.skc)——在Windows或Macintosh环境下,存储并传输 到另外的ISIS应用程序中 6

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