矮牵牛的查尔酮合酶（CHS）基因的生物信息学分析.PDFVIP

·34 · 矮牵牛的查尔酮合酶(CHS)基因的生物信息学分析 汪结明，王凤玲，李瑞雪，魏万亮 （湖南科技大学生命科学学院，湖南湘潭411201 ） 摘 要：为研究CHS(chalcone synthase)基因间的同源性及其进化关系，以矮牵牛的CHS 基因为研究对 象，利用生物信息学软件及网站对其进行碱基分布、氨基酸组成和亲疏水性预测，并与其他10 个物种的 CHS 基因序列进行多重比对、进化分析。结果表明：矮牵牛的CHS 基因的单链mRNA 序列含有1170 个 碱基对，蛋白质由389 个氨基酸编码，相对分子质量为42580.02 ，其中亮氨酸(Leu)含量最高达10.80% ； 疏水值最大为2.038 ，最小为-2.208 ，无明显的亲水或疏水区域；多重比对发现11 个物种同源性达到了 80.55% 。通过以上结果得出CHS 基因处于稳定状态，编码的蛋白为亲水性蛋白，进化过程中是保守的， 获得的保守区段的序列信息为新基因的克隆奠定了基础。 关键词：查尔酮合成酶基因；花色；生物信息学；序列分析 中图分类号：S68 文献标志码：A 论文编号：2011-0248 Analysis on Bioinformatics of Chalcone Synthetase Gene in Petunia hy brida Vilm. WangJieming,WangFengling,LiRuixue,WeiWanliang (School of Life Sciences,Hunan University of Science and Technology,Xiangtan411201,Hunan,China) Abstract:Tostudythehomologyandevolutionaryrelationshipsamong CHS (chalcone synthase)genes, and using the CHS gene in Petunia hybrida as studied object, its base distribution, amino acids compositionandhydrophobicityorhydrophilicitywereanalyzedbythesoftwareandbioinformaticswebsite,as wellasmultiplecomparisonsandphylogeneticanalysiswithother 10 species.ThemRNAsinglesequence contained 1170bpbase,thenumberofaminoacidsencodingproteinwas389anditsrelativemolecularmass was 42580.02, leucine gave the highest content of 10.80%, hydrophobic maximum value was 2.038, hydrophobicminimumvaluewas-2.208,andnoobvioushydrophilicorhydrophobicareawasfound.The homologyofmultiplecomparisonsoftheaminoacidsequenceforCHSgenesin 11speciesachieved80.55%. Thegeneswereinastablestate,encodedproteinwashydrophilicprotein,andtheevolutionaryprocesswas conservative.Theconservativesequenceinformationachievedinthese CHS geneslaida