微卫星DNA标记与新扬州鸡蛋用性状的相关研究.pdfVIP

垄皇壑!丝卫里里型垒堑塑兰塑塑型璺茎堕壁鉴堕塑茎型!塞——一3 它遗传标记相比(包括蛋白质标记、RFLP、RAPD等)具有较大的优越性。 1．4．1蛋白质标记 蛋白质标记虽然是结构基因的直接产物，它们在种类、数量、大小及结构等 Jff]毕竟是 方面的多样性能在一定程度上反应不同品种DNA组成上的差异，但’-C 基因表达加]：后的产物，只能间接反应很少一部分DNA分予的多态性“”…1。从分 子水平看，编码蛋白质的基因未发生改变，但该基因是否表达或表达的量还受其 它因素的影响，而且，该基因转录或翻译后产物的加工方式不同也可能导致不同 的蛋白质类型：另一方面，基因内部个别碱基的突变也不一定导致蛋白质产物的 改变。因此，蛋白质的变异不能完全反映基因的变异“…。 1．4．2 RFLP标记 RFLP主要是由于碱基突变导致限制性酶切位点的丢失。因此，大多数RFLP 表现为二态性，杂合率低于50％，所提供的信息量低，多态信息含量仅为0．2左 右。而微卫星在基因组中均匀分布、等位基因数目多，并且微卫星DNA属于非 结构基因序列，在进化过程中所受的选择压力小，更能准确的反映群体遗传分化 过程及亲缘关系。因此，在区分亲缘关系极近的个体(或群体)时的效率要比RFLP 高，且在估测遗传多样性时要比RFLP标记等的信息含量要大“…。 1．4．3RAPD标记 RAPD是由于一定区域内DNA片断的插入、缺失所致，微卫星是减数分裂过程 中不平衡交换所致。RAPD大多数为显性遗传，微卫星多态性为共显性遗传。由于 微卫星标记多态性程度高，且共显性遗传，因而通过计算杂合度可较好地反映群 体内的变异和种群间关系，还可应用于动物个体鉴别等方面。而RAPD所用的引物 数目多，可获得品种的特异性条带，因此RAPD一般可用在群体间的区别以及品种 的划分上，甚至可为某一群体的特征提供明确而直接的信息。但与微卫星DNA 相比，RAPD标记的扩增结果的重复性较差”1。 1．4．4小卫星标记 小卫星标记作为DNA标记存在着不足，首先，小卫星在基因组中并不是均 匀分布的，只是更常见于染色体末端，而微卫星在基因组中的分布范围更大。其 次，用于长度多态性分型的最快方法是通过PCR，而PCR分型对于300bp以下 序列更精确，但大多数小卫星等位基因由于其重复单位相对较长，而且在一个序 列中常有许多重复，因此长度一般大于300bp“…。 扬州大学硕士论文 1．5微卫星DNA标记与数量性状相关分析理论基础…… 遗传标记的发现及遗传标记与数量性状间的连锁关系是数量性状基因剖分、 定位的突破口，尽管多数情况下标记座位本身并不是QTI，，但它们可能与QTL相 连锁。利用QTL与标}己座位之问的连锁关系及遗传标记图谱，就能更准确地获得 基因从亲代向予代的传递情况，也可以了解一个被研究的数量性状受多个QTL控 制，它们位于染色体的位置，以及它们对于该性状表达的独立效应和联合效应。 1，5．i遗传标记用于数量性状分析的试验设计 利用多种标记来分析标记与数量性状问的关系是因为标记基因座位可能与控 制某数量性状的基因存在着连锁关系。通常采取三个步骤进行分析：(1)建：立目 标性状有差异分离群，如高产蛋鸡与低产蛋鸡两个品系或品种杂交F。代，F．代全 同胞或半同胞交配引起性状分离；(2)对群体各个个体或品系进行性状分离测定， 分析遗传标记基因型：(3)根据标记基因型的种类或目标性状的表现将分离群体 分成几个亚群体，采用方差分析来比较同一标记不同基因型对应经济性状表型值 的差异，或者高低表型亚群体问的表型值差异，以寻找性状与一个或多个标记的 遗传相关，当基因型对应的表型值存在着显著差异时，分子标记与控制数量性状 基因连锁，即在标}己座位左右存在着一个或多个QTL与该数量性状位点相关。 1．5，2遗传标记与数量性状相关分析的方法 TB(Trait based)分析法(主要是以表型性状为基础的分析法)：TB法由于 选择的结果改变了QTL处于分离状态的增效或减效等位基因的频率，使数量性状 的高表型个体中QTL增效等位基因以及低表型个体中减效等位基因频率的增加， QTL等位基因与其相邻标记等位基因之间的免费搭车的效应将使标记等位基因 的频率发生相应的变化，当QTL等位基因与某一标记基因连锁时，出于相互关联 的