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实验报告
题目:单元二:目的基因的克隆、转化及重组子筛选
指导老师:丛佩清
日期:2013/10/24-2013/10/26
一.实验目的:
(1)学习和掌握DNA片段胶回收的方法。
(2)学习DNA连接的有关技术。
(3)掌握用CaCl2 法制备感受态细胞的原理和方法。
(4)学习和掌握质粒DNA的转化和重组质粒的筛选方法。
(5)掌握质粒提取的基本方法。
(6)学习和掌握限制性内切酶的使用方法。
二.实验原理:
cDNA的TA克隆:Taq酶能够在PCR产物的3’末端加上一个非模板依赖的A,而T载体是一种带有 3’T突出端的载体,在连接酶作用下,通过粘性末端连接,把PCR产物插入到质粒载体的多克隆位点,称为 T-A克隆。可用于PCR产物的克隆和测序。
感受态细胞制备原理:细菌处于容易吸收外源DNA的状态叫感受态,细菌处于0℃,CaCl2 的低渗溶液中,细胞膨胀,细胞壁通透性增强,在冷热变化刺激下细胞膜表面产生裂隙,使外源DNA进入。
蓝白斑筛选:载体带有一个LacZ基因的调控序列和头146个氨基酸的编码信息,编码α-互补肽;宿主细胞编码C端部分序列。诱导物IPTG 和乳糖的结构相似,可以与乳糖操纵元的阻遏蛋白结合,从而解除阻遏蛋白的作用,使载体得以合成α-互补肽,与宿主细胞编码的C端部分结合形成β-半乳糖苷酶,而X-Gal是β-半乳糖苷酶的显色底物,在β-半乳糖苷酶的催化下会产生蓝色产物。可用于重组克隆的筛选,重组克隆无法产生α-互补肽,因而无法使X-Gal显色,培养基上表现为白色菌落。
三.实验材料:
大肠杆菌DH5a、LB培养基、0.1mol/LCaCl2溶液、Binding Buffer、spin-column、SPW溶液、1μlpMD19-T Vector、5μlSolution Ⅰ、250μlSolution Ⅰ、250μlSolution Ⅱ、350μlSolution Ⅲ、HiBind ? Mini Columns (I)、500 μlBuffer HB、1400 μlDNA Wash Buffer等
四.实验步骤、现象、结果及分析:
Ⅰ10月24号
(1)cDNA电泳及胶回收
1. 取上周制备的置于-20℃冰箱保存的目的基因产物1、2、3组DNA样品,选取其中2号组及3号组进行琼脂糖电泳,因1号组RT-PCR琼脂糖凝胶电泳有杂带故弃而不用,1、3号组DNA样品(已加入loading buffer)分别加入SYBR Gold2μl,1%琼脂糖电泳,紫外灯下切胶。
2.把所割胶放入1.5 ml EP管,称重如下表一。
表一:cDNA琼脂糖凝胶重量
空管
2管
3管
重量(g)
0.9045
1.2280
1.2961
净重(g)
0.3235
0.3916
3.按1g/1ml 的量,大致各加入400μl Binding Buffer,65℃水浴 7min;(每隔2-3 min,摇一下);
4.把溶液转移至spin-column,10000g 离心1 min ,倒出套管内残液;
5.在柱子中加入300μl Binding buffer,10000g 离心1min,倒出套管内残液;
6.在柱子中加入700ul 的 SPW 溶液,放置 3min,10000g 离心 1min ,去残液;
7.10000g 离心 1min(去乙醇);
8.把柱子放入干净的 1.5ml EP 管。加Elution Buffer 20μl。室温放置 1min,10000g 离心 1min。
9.检测DNA的纯度和浓度,如下表二所示。选取质量好的2号组进行接下来的连接转化。
表二:cDNA吸光度测定
2组
3组
A260/A280
1.864
1.867
浓度(ng/μl)
146.718
128.242
(2)感受态细胞制备
1.从新鲜培养的LB平板上挑单个DH5a大菌落接种到3mlLB培养液中,37 ℃ 剧烈振荡培养过夜(教师准备)。
2.取过夜培养的大肠杆菌DH5a按 1:50 取1ml菌液接种到 50ml LB 培养基中,37 ℃ 振荡培养,1hr后用分光光度计测其OD值为0.182,1.5 hr后再测其OD值,为0.304,到达其对数生长期(细菌对数生长期 OD 600 为 0.2-0.4)。
3.分别取1ml 菌液至1.5 ml 离心管中标记为1号、2号、3号,培养物冰上放置 10 min,5000 r/min,离心 2 min ,用枪头吸取废液,弃去,收集底部菌体。
4.分别加入500μl预冷的 0.1 mol/L CaCl2 ,用枪头吹散,使菌体悬浮于预冷的 CaCl2 中,冰上放置10分钟。
5.离心机5000
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