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三引物设计 ATGACTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTGGTGGCGTAGGCAAGAGTGCCTTGACGATACAGCTAATTCAGAATCATTTTGTGGACGAATATGATCCAACAATAGAGGATTCCTACAGGAAGCAAGTAGTAATTGATGGAGAAACCTGTCTCTTGGATATTCTCGACACAGCAGGTCAAGAG 野生型引物(F) 5’-CTTGTGGTAGTTGGAGCTG-3’ 19nt,51℃ 突变型引物(F) 5’-CTTGTGGTAGTTGGAGCTA-3’ 19nt,49℃ 下游引物(R) 5’-CCTCTATTGTTGGATCATATTCGTC-3’ 25nt,54℃ 三引物设计—下游引物设计 ATGACTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTGGTGGCGTAGGCAAGAGTGCCTTGACGATACAGCTAATTCAGAATCATTTTGTGGACGAATATGATCCAACAATAGAGGATTCCTACAGGAAGCAAGTAGTAATTGATGGAGAAACCTGTCTCTTGGATATTCTCGACACAGCAGGTCAAGAG 选择序列: 5’-GACGAATATGATCCAACAATAGAGG-3’ 互补链: 3’- CTGCTTATACTAGGTTGTTATCTCC-5’ 下游引物: 5’- CCTCTATTGTTGGATCATATTCGTC -3’ 3’端增加错配 如果3’端是弱错配(C/A或G/T)则需要引入强的错配(A/G或C/T)才可阻断3’端的扩增; 如果3’端是强错配(A/G或C/T)则需要引入弱的错配(C/A或G/T)或不需引入错配即可阻断3’端的扩增; 当3’端是中度错配(A/A,C/C,G/G 或T/T)则需要引入中度的错配。 野生型引物(F) 5’-CTTGTGGTAGTTGGAGCTG-3’ 突变型引物(F) 5’-CTTGTGGTAGTTGGAGCCT-3’ 下游引物(R) 5’-CCTCTATTGTTGGATCATATTCGTC-3’ 四引物设计 四引物设计 ATGACTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTGGTGGCGTAGGCAAGAGTGCCTTGACGATACAGCTAATTCAGAATCATTTTGTGGACGAATATGATCCAACAATAGAGGATTCCTACAGGAAGCAAGTAGTAATTGATGGAGAAACCTGTCTCTTGGATATTCTCGACACAGCAGGTCAAGAG 内引物(F) 5’-CTTGTGGTAGTTGGAGCTA-3’ 内引物(R) 5’-ACTCTTGCCTACGCCACC-3’ 外引物(F) 5’-ATGACTGAATATAAACT-3’ 外引物(R) 5’-CTCTTGACCTGCTGTGTCG-3’ KRAS试剂盒开发简介 KRAS突变探针和引物设计 KRAS序列: ATGACTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTGGTGGCGTAGGCAAGAGTGCCTTGACGATACAGCTAATTCAGAATCATTTTGTGGACGAATATGATCCAACAATAGAGGATTCCTACAGGAAGCAAGTAGTAATTGATGGAGAAACCTGTCTCTTGGATATTCTCGACACAGCAGGTCAAGAG 1. 5’-CTT GTG GTA GTT GGA GCT TA-3’ 12GGT — GAT 2. 5’- AAA CTT GTG GTA GTT GGA GCG GT-3’ 12GGT — GTT 3. 5’- AA CTT GTG GTA GTT GGA GCT GC-3’ 12GGT — GCT 4. 5’- ATAAA CTT GTG GTA GTT GGA GCT A-3’ 12GGT — AGT 5. 5’- AA CTT GTG GTA GTT GGA GCG T-3’ 12GGT — TGT 6. 5’- ATAAA CTT GTG GTA GTT GGA GCC C-3’ 12GGT — CGT 7. 5’- GTG GTA GTT GGA GCT GGT AA-3’ 13GGC — GAC 8. 参照引物:5’-CT GAA TAT AAA CTT GTG GTA GTT-3’
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