单核苷酸多态性微阵列芯片在早期自然流产绒毛组织遗传学分析中的应用.PDF

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单核苷酸多态性微阵列芯片在早期自然流产绒毛组织遗传学分析中的应用.PDF

浙 江 大 学 学 报 ( 医 学 版 ) 2017年6月   JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY (MEDICAL SCIENCES) June2017 http:∥www.zjujournals.com/ med DOI:10.3785/ j.issn.1008 ̄9292.2017.06.06 原  著 单核苷酸多态性微阵列芯片在早期自然流产 绒毛组织遗传学分析中的应用 孙义锡ꎬ罗玉琴ꎬ钱叶青ꎬ董旻岳ꎬ金  帆 浙江大学医学院附属妇产科医院生殖遗传科 生殖遗传教育部重点实验室ꎬ 浙江杭州31006     [摘  要]  目的:探索单核苷酸多态性(SNP)微阵列技术在流产组织遗传学分析 中的应用价值ꎮ 方法:收集2013年10 月至2016年6 月浙江大学医学院附属妇产 科医院不明原因早期自然流产的861例患者的绒毛组织ꎬ采用SNP 芯片技术对流 产绒毛组织的全基因组DNA拷贝数变异进行检测ꎮ 结果:SNP芯片成功检测所有 绒毛组织ꎬ成功率为100%ꎮ 染色体异常检出率为51.10%(440/ 861)ꎬ包括染色体 非整倍体358份(41.58%)ꎬ其分布于除1号染色体外所有染色体ꎻ三倍体21份 (2.44%)ꎻ单倍体1份(0.12%)ꎻ单一位点缺失或重复37份(4.30%)ꎬ其中25例 缺失或重复片段小于10 Mbꎬ对其中6例致病性不明确的病例进行夫妇芯片验证ꎬ 结果显示4份为新发突变ꎬ2 份遗传自夫妇一方ꎻ同时具有两位点缺失或重复23 份(2.67%)ꎬ对其中17 份结合夫妇芯片及染色体核型、荧光原位杂交验证ꎬ发现 新发突变6份ꎬ夫妇存在小片段平衡结构异常11份ꎮ 结论:SNP微阵列芯片可对 流产绒毛组织进行相对全面的遗传学分析ꎬ发现引起流产的各种遗传因素ꎮ [关键词]  多态性ꎬ单核苷酸ꎻ微阵列分析ꎻ基因表达ꎻ流产ꎬ自然/ 遗传学ꎻ染色 体畸变ꎻ绒毛膜绒毛/ 病理生理学ꎻ变异(遗传学) [中图分类号]  R394ꎻR446    [文献标志码]  A Single nucleotide polymorphism ̄array in genetic analysis of chorionic villi from early spontaneous miscarriages SUN Yixiꎬ LUO Yuqinꎬ QIAN Yeqingꎬ DONG Minyueꎬ JIN Fan (Department of Reproductive Geneticsꎬ Womens HospitalꎬZhejiang University School of MedicineꎬKey Laboratory of Reproductive GeneticsꎬMinistry of EducationꎬHangzhou310006ꎬChina) Corresponding author:JIN FanꎬE ̄mail:jinfan@zju.edu.cnꎬhttp:/ / orcid.org/ 0000 ̄ 0003 ̄1717 ̄2733 [Abstract]  Objective: To assess the clinical application of single nucleotide 收稿日期:2017 ̄02 ̄15    接受日期:2017 ̄05 ̄29 基金项目:国家自然科学基金ꎻ浙江省自然科学基金(LZ15H040001ꎬLQ17H040001ꎬLY14H040009) 第一作者:孙义锡(1983—)ꎬ男ꎬ博士ꎬ住院医师ꎬ主要从事生殖遗传学研究ꎻE ̄mail:sunyixi123456@zju.edu.cnꎻhttp:/ / orcid.org/ 0000 ̄0002 ̄2240 ̄3607 通讯作者:金  帆(1958—)ꎬ男ꎬ硕士ꎬ教授ꎬ主任医师ꎬ博士生导师ꎬ主要从事生殖遗传学研究

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