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鼻咽癌的基因變化
癌症是一種基因疾病,就像大部分的癌症,鼻咽癌也因很多步驟的基因變化累積而形成,其中包括致癌基因的活化及抑癌基因的去活化等。要解開致癌之謎的第一步,首先要了解癌症的基因產生何種變化,然後再縮小範圍,針對有問題的基因,進一步深入分析。致癌基因的活化會表現出基因增加的現象;抑癌基因的去活化,可因基因缺失所致,因此看一種癌症基因的增加與減少,可推測那些致癌基因及抑癌基因參與致癌過程。比較型基因組雜交法(comparative genomic hybridization, CGH)在一次的實驗,可得知23對染色體上基因的增減情形,提供一個整體,比較大範圍的基因變化全貌。
鼻咽癌經CGH實驗後,發現主要有以下的變化:基因增加出現於染色體12p(59%),1q(47%),17q(47%),近中央節的11q(41%),12q(35%),9q(24%)及8(24%);基因缺失的有染色體3p(53%),9p(41%),13q(41%),14q(35%),靠遠端的11q(29%),5q(25%)及16q(19%)。比較台灣和香港鼻咽癌的結果,發現兩者最主要的差異是,前者9q的基因增加較多,沒有基因減少的情形;11q,17q基因增加的情形較多。而後者9q少有基因增加的情形,卻高達60%(12/20) 有基因缺失;11q,17q少有基因增加,反而是19,20有較多基因的增加。可見兩地鼻咽癌的基因變化還是有差異,雖同是華裔,還是有不同點。共同點是1q,8,12有基因增加;3p,9p,11q,13q,14q有基因缺失[1,2]。
重要的是,有基因缺失的染色體目前已知有很多抑癌基因,如9p21有MTS1(multiple tumor suppressor 1)/p16和MTS2基因;11q21-23有ATM基因;3p14.2有FHIT(fragile histidine triad);5q21有APC;16q22.1有E-cadherin基因。但3q12的BRCA2及13q14的RB1,並不在鼻咽癌13q21-32的缺失處;p53所在的17p13,在鼻咽癌也沒有缺失,這和絕大部分的報告,鼻咽癌並沒有RB及p53基因的突變或其他變化相符合。另外利用PCR-single strand conformational polymorphism(SSCP)及序列分析,發現p53基因作用過程的下游基因p21,又名WAF-1及CIP-1,也沒有點突變的現象,顯示RB及 p53基因的去活化,在鼻咽癌的致病過程並不重要[3]。有基因增加的染色體有致癌基因的有:11q13的CCND1(cyclin D1)和INT2;2p12.1有RASK;12p13有CCND2和TEL;12p有PTHLH(parathyroid hormone-related polypeptide);12q有CDK4、INT1、MDM2;8q24有c-MYC等一些致癌基因。
為了進一步了解鼻咽癌細胞染色體上更小區段的缺失,藉助看失異合性(loss of heterozygosity, LOH) 的情形,可得知更詳細、更精確的基因缺失現象。因為每對同源染色體當中,一條來自父親,一條來自母親,其中有很多多形標記,可區分何者來自父親,何者來自母親,所以有異合性(heterozygosity),由於抑癌基因的去活化最常見於,一等位基因的缺失加另一等位基因的點突變,如果兩同源染色體之一有一段基因缺失,謂之失異合性。以前利用有多形性,含有許多重複序列的微衛星標記(microsatelite marker),附上放射性同位素於引子,經PCR、電泳、曝光,比較正常細胞和癌細胞的多形標記,如果癌細胞有一條標記不見了,或是含量是正常細胞的一半以下,謂之有LOH,表示該標記所在染色體區段附近,可能有重要的抑癌基因,因細胞失去該基因,加上另一等位基因有點突變而致癌。由於使用同位素較麻煩、費時,所以斷斷續續出現報告,指出鼻咽癌在第3,9,11,13,14對染色體有LOH,尤其9p21-22有純合性缺失(homozygous deletion) [4]。後來有附上不同顏色的螢光標記,藉助電腦化,可以安全又快速處理龐大資料,所以可以做全基因組的失異合性定位,利用含有三種螢光之一,分布於23對染色體上的382個微衛星標記,進行複合式PCR(multiplex PCR),一支反應試管可放入多個標記的引子,電泳時同一電泳槽可放入同長度、不同顏色,或不同長度、同顏色的標記,經雷射激光,電腦紀錄、判讀,可比傳統同位素法快上幾十倍,結果發現鼻咽癌失異合性的比率依次是:3p(96.3%),9q(88.9%),9p(85.2%),14q(85.2%),11q(74.1%),12q(70.4%),13q(55.6%),1
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