第9章 基因型与环境间的互作.pptx

第9章 基因型与环境间的互作;基因和环境对表型的共同作用;本章的主要内容;§9.1 宏环境、微环境和目标环境群体;宏环境和微环境;宏环境和微环境在效应上的差异;环境效应的部分可预测性;目标环境群体;基因型和环境的互作研究;基因型和环境的互作模型;基因和环境对表型的贡献;基因和环境互作的利用;两个基因型在两个环境下的平均表现及基因型和环境效应的计算;两个基因型在两个环境下基因型和环境互作效应的计算;基因型与环境交互作用的4种模式;非交叉基因型与环境交互作用;非交叉基因型与环境交互作用;交叉基因型与环境交互作用;交叉基因型与环境交互作用;两个小麦品种在2个环境下的赤霉病感染率（%）;基因型和环境互作的利用途径;方式1：忽略基因型与环境互作（ignore it）;方式2：降低基因型与环境互作（reduce it）;方式3：利用基因型与环境互作（exploit it）;§9.2 多环境表型鉴定试验的方差分析;表型的分布;总平均、基因型平均和环境平均;基因型效应、环境效应和互作效应;基因型值和表型值的线性分解模型;遗传方差、环境方差和互作方差;完全随机区组的多环境表型数据;利用表型数据的平均数估计各种效应;利用表型数据的平均数估计各种效应;多环境重复表型观测值的方差分析表（不考虑区组效应）;多环境试验的区组效应估计;多环境重复表型观测值的方差分析表（考虑区组效应）;平均表现的估计值及其方差;表型方差的构成;广义遗传力估计;重复平均数的方差构成;重复平均数的遗传力;重复平均数的遗传力;表7.3 水稻双亲衍生的10个RIL家系在三个环境下的直链淀粉含量（%）;三个环境的联合方差分析（不含区组效应）;三个环境的联合方差分析（不含区组效应）;三个环境的联合方差分析（含区组效应）;三个环境的联合方差分析（含区组效应）;误差方差的异质性;异质误差方差的表型分布;异质误差方差的样本均值及其方差;异质误差方差的最优线性无偏估计;异质误差方差的最优线性无偏估计;方差同质性的Bartlett检验;两个水稻亲本和它们的10个RIL家系直链淀粉含量（%）平均表现的估计值;多环境联合方差分析;基因型的环境和重复平均数的方差;可检测到的最小显著性差异;环境数和重复数对LSD的影响;评价基因型的适宜环境数和重复数 ;重复的必要性;评价基因型的适宜重复数 ;增加环境的重要性;§9.3 基因型的环境稳定性分析;目标环境群体（TPE）的分类;环境间距离的度量;5个环境样本之间的距离矩阵;类平均聚类方法;5个环境的聚类图;聚类的个数;基因型和环境双向表;水稻10个RIL家系在3个地点的平均直链淀粉含量（%）及各种效应的估计值列平均又称环境平均或环境指数（environmental index）;平均直链淀粉含量的散点图;基因型的环境稳定性分析;环境稳定性的Finlay-Wilkinson分析方法;稳定性的判定方法;10个RIL家系对三个地点的回归系数;稳产与高产的关系;稳定性的Eberhart-Russell分析方法;离回归方差的计算;稳定性的判定方法;稳定性的判定方法;基因型对环境的反应类型;稳定性分析的育种价值;基因型和环境互作的乘积模型;AMMI乘积模型;AMMI乘积模型对互作效应的分解;AMMI乘积模型对表型的预测;AMMI乘积模型的双标图;包含7个基因型（用G1~G7表示）和10个环境（用E1~E10表示）的AMMI分析双标图;AMMI分析的主成分数和育种价值;附：关联分析的丢失遗传力现象;Heritability is missing in GWAS! (B. Maher, 2008. Nature, 456: 18-21) ;1. How was Heritability found, defined and estimated 100 years ago? ;Hereditary Stature by F. Galton (1886);Regression of son on father’s height;;Components of genetic value and components of genetic variance;Estimation of Heritability in animals(Falconer and Mackay “Introduction to Quantitative Genetics”, p162);Nature Reviews Genetics, 2008, 9: 255-266;2. Heritability is missing in GWAS. That’s too sad and too bad! ;What is missing Heritability?;Evidence of