蛋白质分子结构.pptVIP

非共价键 本质 参与基团或原子 氢键 静电作用 由电负性原子与氢形成的基团＋电负性强带有孤对电子的原子 范德华力 静电作用 非极性基团 疏水作用 熵驱动 疏水基团 离子键 静电作用 带电荷的基团 稳定蛋白质三维结构的作用力 ? 氢键对维持二级结构特别重要 ? 疏水作用对维持三级结构特别重要 这些非共价键以量取胜，它们不仅稳定了蛋白质的三维结构，对蛋白质的功能也有重要影响作用 稳定蛋白质三维结构的作用力 疏水核： 疏水区多位于分子内部，?往往? 是与辅酶/基或底物结合的位点 维持蛋白质三级结构稳定的因素 亲水区： 亲水区多位于分子表面，?故球? 形蛋白质水溶性较好? 蛋白质三级结构的其它特点： 许多在一级结构上相差很远的氨基酸碱基在三级结构上相距很近。 三级结构是蛋白质发挥生物活性所必须的。 所有具有高度生物学活性的蛋白质几乎都是球状蛋白。 球状蛋白的三级结构很密实，大部分的水分子从球形蛋白的核心中被排出，这使得极性基团间以及非极性基团间的相互用成为可能。 蛋白质的三级结构 　　许多蛋白质是由两个或两个以上独立的球状蛋白质通过非共价键结合成的多聚体，称为寡聚蛋白。寡聚蛋白中的每个独立的球状蛋白质称为亚基（subunit），亚基一般由一条肽链构成，也称为单体（monomer）。蛋白质的四级结构是指亚基的种类、数量以及各个亚基在寡聚蛋白质中的空间排布和亚基间的相互作用。 四、蛋白质的四级结构 (Quaternary structure) 蛋白质的四级结构 四级结构的特点 亚基单独存在时无生物活性，只有相互聚合成特定构象时才具有完整的生物活性 亚基之间以非共价键结合，容易彼此解离 一级结构规定了亚基间的结合方式，四级结构的形成遵从“自我装配”的原则 大多数寡聚蛋白质分子的亚基的排列是对称的，对称性是四级结构蛋白质最重要的性质之一 四、蛋白质的四级结构 测定蛋白质在溶液中的 整体或部分构象 荧光光谱 紫外差吸收光谱 近紫外圆二色性光谱 蛋白质分子全部空间结 构的测定 X射线晶体衍射 多维核磁共振方法(NMR) 蛋白质构象的研究方法 五、蛋白质的理化性质 蛋白质与多肽的区别： 分子量、 空间结构 当多肽的分子量大到足够具有一定的空间结构时就称为蛋白质 蛋白质的两性电离和等电点 蛋白质的胶体性质 蛋白质的沉淀反应 变性是指蛋白质受物理或化学因素的影响，使蛋白质分子原有的特定的空间结构发生改变，从而导致蛋白质性质的改变以及生物活性的丧失 肽链从紧密有序结构→松散无序的结构 蛋白质的变性 (denaturation） 变性因素： 化学：酸、碱、有机溶剂、蛋白变性剂（尿素、盐酸 胍）、 重金属盐等 物理：加热、紫外线、X-射线、超声波、剧烈震荡等 五、蛋白质的理化性质 变性蛋白质的主要特征 蛋白质分子中的次级键断裂，构象破坏，但不涉及共价键的破坏，一级结构不变，一些侧链基团暴露，可滴定基团增加 生物活性全部或部分丧失 一些物理化学性质的改变：变性蛋白质的溶解度常降低、粘度增加而扩散系数减小 生化性质的改变：变性蛋白质容易消化 概念：除去变性因素后，有的变性蛋白 质又可恢复其天然构象和生物活 性，这一现象称为蛋白质的复性 蛋白质的复性(renaturation) 变性的可逆性 六、蛋白质的结构与功能 蛋白质的一级结构决定其空间结构 蛋白质的空间结构决定其特定的生物功能 氨基酸一级结构的改变可以导致蛋白功能的改变和丧失 蛋白质分子结构与功能的关系 蛋白质分子具有多样的生物学功能，需要一定的化学结构，还需要一定的空间构象 （一）蛋白质一级结构与功能的关系 1.种属差异 蛋白质一级结构的种属差异十分明显，但相同部分氨基酸对蛋白质的功能起决定作用。根据蛋白质结构上的差异，可以断定它们在亲缘关系上的远近 2.分子病 蛋白质分子一级结构的氨基酸排列顺序与正常有所不同的遗传病 一级结构与功能的关系 一级结构的变异与分子病 1 2 3 4 5 6 7 8 HbA: N’ Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu-Glu-Lys HbS: N’ Val-His-Leu-Thr-Pro-Val-Glu-Lys (β链) 正常的红细胞（左图）与镰刀状红细胞（右图）的区别 血红蛋白单个（2个）氨基