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1 .什么叫基因工程(Gene Engineering),试从理论和技术两个方面谈谈Gene Engineering诞生的基础?
基因工程:在体外将核酸分子插入病毒、质粒或其它载体分子,构成遗传物质的新组合,并使之参入到原来没有这类分子的宿主细胞内,而能持续稳定地繁殖。
理论基础:① 1944年,美国生物学家Avery等通过细菌转化研究,证明DNA是基因载体,即基因的分子载体是DNA而不是蛋白质,从而明确了遗传的物质基础问题;
②1953年Watson和Crick建立了DNA分子的双螺旋结构模型, 1958年至1972年揭示了先后确立了中心法则,破译了64种密码子
技术基础:①20世纪60年代末70年代初,限制性核酸内切酶和DNA连接酶的发现使DNA分子进行体外的切割和连接成为可能;
②1972年首次构建了一个重组DNA分子,提出了体外重组的DNA分子如何进入宿主细胞,并在其中进行复制和有效表达等问题。经研究发现,质粒分子是承载外源DNA片段的理想载体,病毒,噬菌体的DNA(或RNA)也可改造成载体
③1973年大肠杆菌转化体系的建立,这实验结果说明基因工程问世,不仅宣告质粒分子可作为基因克隆载体,能携带外源DNA导入宿主细胞,并且证实真核生物基因可转移到原核生物细胞中,并在其中实现功能的表达(基因工程诞生的元年)
克隆:作为名词使用时,是指某一个体(或细胞、分子等)通过无性繁殖的方式产生的具有相同遗传背景的后代(或子细胞、分子等)组成的集体(或群体);作为动词使用时,指产生上述集体或群体的过程。
质粒小量提取中,溶液Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ作用是什么?
溶液Ⅰ是使细胞完全分散 溶液Ⅱ是使细胞壁破裂,DNA变性 溶液Ⅲ是使质粒选择性复性,而染色体DNA随同SDS和蛋白质一起沉淀下来
限制性核酸内切酶(Restriction endonuclease):是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列(4—8bp),并由此处切割DNA双链的核酸内切酶。
RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)限制片段长度多态性:指用某一种限制性内切酶来切割来自不同个体的基因组DNA或某一个基因,会得到不同长度的DNA片段。可用于基因组图谱构建、致病基因检测、基因定位、生物进化和分类的研究等
?限制性图谱(restriction map):是指一系列限制酶的特异识别序列在DNA链上的出现频率和它们之间的相对位置。又称物理图谱(physical map)
核酸限制性内切酶的类型及主要特性
特性
I类内切酶
II类内切酶
III类内切酶
限制和修饰活性
单一多功能的酶
内切酶和甲基化酶分开
共同亚基的双功能酶
内切酶的蛋白结构
3种不同的亚基
单一成分
2种不同的亚基
限制作用所需要的辅助因子
ATP、Mg2+和SAM
Mg2+
ATP、 Mg2+和SAM
寄主特异性位点识别序列
EcoB: TGA(N)8TGCT EcoK:AAC(N)6GTGC
回文序列
(IIs型除外)
EcoP1:
AGACC
EcoP15:
CAGCAG
切割位点
在距离识别位点至少1000 bp处随机切开一条单链。
位于寄主特异性位点或其附近
距寄主特异性位点3‘端24—26bp处
酶催转换
不能
能
能
DNA易位作用
能
不能
不能
甲基化作用的位点
寄主特异性位点
寄主特异性位点
寄主特异性位点
识别未甲基化的序列进行切割
能
能
能
序列特异的切割
不是
是
是
基因工程中的用途
无用
十分有用
?
常用的DNA聚合酶的特点 共同特点 :把dNTPs连续地加到引物的3’—OH端。
主要区别:持续合成能力和外切酶活性不同。2 T7 DNA聚合酶可以连续添加数千个dNTPs而不从模板上掉下来。其它几种DNA聚合酶只能连续添加10多个dNTPs就会从模板上解离下来。
3. 常用DNA聚合酶的特性比较
DNA聚合酶
3’?5
5’?3
聚合速率
持续能力
大肠杆菌DNA聚合酶
低
有
中
低
Klenow fragment
低
无
中
低
T4DNA聚合酶
高
无
中
低
T7DNA聚合酶
高
无
快
高
化学修饰T7DNA聚合酶
低
无
快
高
遗传修饰T7DNA聚合酶
无
无
快
高
逆转录酶
无
无
低
中
Taq DNA聚合酶
无
有
快
高
Taq聚合酶:
TaqDN聚合酶的最大特点是热稳定性,耐高温,非常适合PCR过程的反复高温变性要求。最适温度高 75-80 oC 功能缺点,具有5’?3’聚合酶活性和5’?3’外切酶活性,但没有3‘?5’外切酶活性。 因此不能修复错误的碱基配对!Taq DNA聚合酶的激活剂 金属离子敏感(尤其是Mg2+
末端脱氧核苷酸转移酶(terminal tra
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