食品微生物第十章.ppt

经典的微生物分类方法 经典分类法： 根据少数几种特征进行分类的方法 随机，不系统 经典分类方法的分类依据： 形态特征：个体 群体 生理、生化特征：营养要求（碳源，氮源，生长因子）；代谢产物（种类，产量，显色反应等）；酶（产酶种类，反应特性等） 生态特征：生长温度，对氧需要，酸碱要求，宿主种类等 生活史特点 血清学反应 噬菌体的敏感性 其他 形态特征 形态特征包括个体特征和群体特征。 个体特征： 细胞形态，染色反应，各种特殊构造等 群体特征：菌株在一定的培养基中的菌落特征 菌落形态，在半固体或液体培养基中的生长状态 生理和生化特征 营养来源 多种糖能否被用作碳源和能源，对特定有机化合物和CO2的利用能力 氮源的利用，是蛋白质、蛋白胨、氨基酸或铵盐、硝酸盐中的氮，还是大气中的游离氮。 代谢产物 检测是否形成有机酸、产生气体，能否分解色氨酸产生吲哚，能否还原硝酸盐，能否产生色素或抗生素等 与温度和氧气的关系 经典的分类依据 生态特性 微生物与其它生物的寄生或共生等关系的专一性 微生物在自然界的分布（是否耐高渗、嗜盐） 血清学反应 将已知菌种或菌株制成抗血清，未知菌是否与其发生特异性血清反应 用于微生物的亚种分类、病毒分类（尤其是噬菌体分类） 经典的分类依据 生活史 上代个体经一系列生长、发育阶段而产生下一代个体的全部经历 微生物个体发育的阶段变化 对噬菌体的敏感性 各噬菌体有严格的寄生范围 菌体对噬菌体的敏感性，区分不同类型 现代微生物分类方法 遗传分类法： 从遗传学的角度估价微生物之间的亲缘关系的分类方法 主要的分类依据：GC含量和DNA杂合情况。 ?化学分类法： 指除核酸成分以外的其它化学成分的测定 细胞壁、类脂、细胞色素组成，蛋白质的氨基酸顺序，红外吸收光谱，核磁共振谱等 G+C含量 G+C含量：DNA中碱基G和C在整个DNA中的摩尔百分比。 判断微生物种属间的亲缘关系的远近 亲缘关系越远的种，碱基数目和排列顺序相差越大。 各类微生物的G+C含量：27-75摩尔% G+C含量相差10%以上，肯定不属于同一个种 完全不相关的两种微生物，G+C含量可能相同/近 注意：使用G+C含量性状，必须结合其它性状 DNA杂交试验 原理：不同来源的DNA在体外加热解链，合适条件，使互补的碱基配对结合成双链DNA，然后测定杂合百分率 杂合率越高，两个DNA碱基序列的相似性越高，亲缘关系也越近 两条单链DNA的碱基序列 完全相同，完整双链，杂合率100% 部分相同，生成的“双链”含部分单链，杂合率小于100%。 比较不同来源DNA的碱基序列类似性 DNA-rRNA杂交 16SrRNA寡核苷酸的序列分析 分析后作出相似性图，关系近的集中到一起，关系远的在图上占据不同的位置 细胞壁成分分析 组成单位或结构，明显特殊性 霉菌的细胞壁主要含有几丁质； 细菌细胞壁的主要成分是肽聚糖。 革兰氏阴性菌细胞壁的肽聚糖含量较低，还有多肽、脂蛋白及脂多糖等； 革兰氏阳性菌细胞壁肽聚糖的比例较高，还有蛋白质、多糖、磷壁酸和磷壁质等。 广泛用于放线菌的分类，并作为分属的依据 红外光谱 每种物质的化学结构都具有特定的红外光谱 测定微生物的化学成分 比较适用于“属”的分类，但不适于“种”间分类 优点：简单快速，样品用量少 数值分类法 又称统计分类法 用数理统计方法来处理微生物的各种特征，求出相识值，以相似性的大小决定它们在分类学的关系，并把它们分为各个类群 。 特点： 采用的分类特征较多； 一般是50-60个，多到100个特征以上 “等重原则” 各个分类特征不分主次，均等对待 数值分类法 又称阿得逊氏法（Adansonian classification) 以两两菌株的形态、生理生化特征，对环境的反应和忍受性及生态特征为依据 由计算机计算两者之间的总近似值，列出相似值矩阵，将相似度高的菌株列在一起，然后将矩阵图转换成树状谱（Dendrogram） 基本步骤： 收集50个以上（几百个）数据 分别计算简单匹配相似系数和Jaccard相似系数 列出相似度矩阵 将矩阵图转换成树状谱 优点： 结果偏向少, 所提供的分类群更稳定 有些分类群，数值法和经典法之间已显示出很好的关联度 微生物的数值法分类 项目 经典分类法 数值分类法 分类原则 所用特征有主次之分 所用特征无主次之分 鉴定项目 较少 大量（50到数百） 数据整理 人工统计 计算机运算 检索方法 使用双岐检索表 根据相似系数大小 确定种属 主要特征相同者为同属，次要特征相同者为同种 相似系数小者为同属，相似系数大者为同种 数值分类法与经典分类法的比较 常用微生物的分类鉴定指标 细菌 形态特征和生理生化特征相结合，而又重于生理生化特征 放线菌 以形态和培养特征为主，生理生化和生态特征为辅 酵