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生物物理学导论-04;3 .1 生物大分子的 物理结构测定;;渗透压;范特霍夫定律面临的挑战;非电解质溶液的渗透压;相当稀的大分子溶液;光散射;大分子稀溶液的瑞利系数;浓溶液的M值;3.2 扩散;摩擦和粘度;斯托克斯(Stokes)定律;扩散;费克(Pick)定律;扩散方程;扩散常数测量的实验装置; 由这一实验确定的边界条件(对t=0)是,对x<0,c=0;对x>0, c=c0。方程的解是概率积分;图给出了在不同 t 值,浓度(a)和浓度梯度(b)随 x 变化的情况。扩散在图所示的实验装置中将以光学方法来跟踪,扩散常数D将从概率???分表计算。
;用激光技术测量扩散常数;用激光技术测量扩散常数的优点;3.3 沉降;引力;微粒沉降的匀速度;离心;沉降常数;质量 m和分子量 M;表3.2列出了一些分于在20oC的沉降常数、扩散常数、分子量和密度的倒数(或比容)。;;沉降率和沉降平衡;离心机模式图;;微粒沉降的速率;分子量的表达式;平衡值的测量;密度梯度;3.4 X射线晶体结构分析;1. X射线衍射;;2. 布喇格关系式;;在上图中,平面由联接一行散射单位的直线标出;入射x光与这些平面成角θ,它在相等的角度θ被反射出来。如两相邻平面间的距离为d,当光程差为波长的整倍数时,发生相长干涉(constructive interference)。由此,在下式给出的方向θ观察到衍射极大;产生衍射极大的条件;获得晶体的x射线衍射花样的途径;(b) 用单色x光(用合适的吸收滤片如Ni,选取特征辐射的一条线,如Cu的Kα线获得), 作用于大量分割得很细的具有随机取向的晶体(粉末)上。在这样的随机取向徘布中.有一些细小晶体具备满足布喇格关系式的取向。;(c) 在一固定的单色X光中旋转一单晶,可使θ角改变。从显现在环绕晶体的柱状感光底片上的衍射极大之间的距离,可以测定θ 。当底片以与晶体转动同步的周期来回运动时,则底片上衍射点的位置将直接指出晶体的取向。这一技术广泛地用于精确的结构测定。由于λ 值是固定的,各套反射平面间的距离即可确定,从而可以获得关于晶体结构的信息。另外,衍射点的强度也含有关于晶体精细结构的重要倍息。;3. 米勒指数;;4. 衍射花祥;底片上衍射点之间的间距是由布喇格关系式决定的,并表明反射平面的距离d。;5. 衍射极大的强度;;如果散射元素全都有相同的散射能力,最后的强度将减弱到0,而没有一级(100)衍射极大出现。但是,如散射元素是不同的,则一级(100)衍射极大将仍然表现出来,不过强度会减弱。体心结构的(110)面包含着全部散射元素,因而将出现一强的一级(110)衍射极大,二级反射在(100)面也将表现出强的衍射极大。这完全等价于(200)面的一级反射,在(200)面重又包含了结构的全部散射元素。
;6. 螺旋结构的衍射;;在图3.10所示螺旋的情况下,自每一散射元素来的矢量与前一散射元素的矢量有2π/6的相位差,最后的衍射花样持如图3.11所示。;;7. 相位差;;为求得相位差的一般表达方式,考虑一个二维截面。;相位差的一般表达式;散射波的振幅;晶体的结构因子;8. 博里叶分析;9. 相位问题;同晶置换;尽管x射线结构分析包含大量冗长的工作,但还是有许多蛋白质的结构用这一方法的到了成功地阐明。
著名的成就有肌红蛋白(Kendrew)、血红蛋白(Perutz)和维生素B12(Hodgkin)的结构测定。
这一方法还以极为成功的方式被G ri ck和Watson以及Wilkins用以发现了DNA的双螺旋结构,结果使遗传的分子机理得到了阐明。
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