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使用python进行贝叶斯统计分析数据分析报告
本文讲解了使用PyMC3进行基本的贝叶斯统计分析过程.?
?
# Importsimport pymc3 as pm # python的概率编程包import numpy.random as npr # numpy是用来做科学计算的import numpy as npimport matplotlib.pyplot as plt # matplotlib是用来画图的import matplotlib as mpl
from collections import Counter # ? import seaborn as sns # ? # import missingno as msno # 用来应对缺失的数据
# Set plotting style# plt.style.use('fivethirtyeight')
sns.set_style('white')
sns.set_context('poster')
%load_ext autoreload%autoreload 2%matplotlib inline%config InlineBackend.figure_format = 'retina'
import warnings
warnings.filterwarnings('ignore')
使用python进行贝叶斯统计分析 ?
???
贝叶斯公式 ?
?
贝叶斯主义者的思维方式 ?
根据证据不断更新信念
pymc3 ?
??
常见的统计分析问题 ?
参数估计: "真实值是否等于X"
比较两组实验数据: "实验组是否与对照组不同? "
问题1: 参数估计 ?
"真实值是否等于X?"
或者说
"给定数据,对于感兴趣的参数,可能值的概率分布是多少?"
例 1: 抛硬币问题 ?
我把我的硬币抛了?n次,正面是?h次。 这枚硬币是有偏的吗?
参数估计问题parameterized problem ?
?
先验假设 ?
对参数预先的假设分布:??p~Uniform(0,1)
likelihood function(似然函数, 翻译这词还不如英文原文呢):?data~Bernoulli(p)
# 产生所需要的数据from random import shuffle
total = 30
n_heads = 11
n_tails = total - n_heads
tosses = [1] * n_heads + [0] * n_tails
shuffle(tosses)
数据 ?
In?[4]:
print(tosses)
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1]
In?[5]:
def plot_coins():
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(1,1,1)
ax.bar(list(Counter(tosses).keys()), list(Counter(tosses).values()))
ax.set_xticks([0, 1])
ax.set_xticklabels(['tails', 'heads'])
ax.set_ylim(0, 20)
ax.set_yticks(np.arange(0, 21, 5))
return fig
In?[6]:
fig = plot_coins()
plt.show()
?
代码 ?
In?[7]:
# Context manager syntax. `coin_model` is **just** # a placeholderwith pm.Model() as coin_model:
# Distributions are PyMC3 objects.
# Specify prior using Uniform object.
p_prior = pm.Uniform('p', 0, 1)
# Specify l
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