《基于氢键构筑的含氮_硫化合物研究的文献综述》-毕业设计(论文).docVIP

《基于氢键构筑的含氮_硫化合物研究的文献综述》-毕业设计(论文).doc

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- PAGE 1 - 基于氢键构筑的化合物研究 摘要:化合物的晶体结构中存在多种形式的氢键,诸如N-H…S…H—C,S…H-O-H…N,O…H-N-H…S,[N-H]2…S…H-O等,这充分证实以氮、硫原子作为氢键的受体来构建超分子是可行的。研究发现在pH值8—10之间水溶液中以四合水钼酸铵的为催化剂可将2,5-二巯基-1,3,4-噻二唑分子转变成过硫化合物,这种方法为生物学中二硫键的构建提供了可行的参考,也为超分子构建提供了基础单元。对晶体结构的的分析,发现超分子2a的一维结构是通过氢键形成的左手螺旋链,超分子3a通过氢键作用形成含12个硫原子的24元环结构单元,而配合物4a的二维结构是网格状结构。通过这些分子氢键间的相互作用,超分子和配合物呈现出空间构型各异的一维、二维及三维空间结构。分子间氢键的存在也使得这些超分子和配合物的结构变得更加稳定。 关键词:氢键、超分子、晶体结构、化合物、结晶 1.1氢键作用的意义 氢键(hydrogen bond)是一种广泛存在的分子级别的弱作用力。氢键作用的范围非常广泛,在水及其溶液、结晶水合物,羧基溶剂、醇、无机酸、酸式盐、碱式盐,碳水化合物、氨和氨合物、酰胺、氨基酸、蛋白质等物质中氢键都扮演着重要角色。它的存在,影响着许多物质的存在状态以及许多重要的物理性质。氢键作用存在于一些无机和有机分子之间,有机分子之间,许多有机分子本身的内部以及生物大分子之中。在生命科学研究领域,1951年蛋白质的α螺旋和β折叠结构的发现,以及1953年DNA双螺旋结构中碱基对堆积作用的确认,使得人们进一步认识到了这种分子间弱相互作用在生物大分子体系和生命过程中的作用,至此人们对氢键的研究也受到重视,研究也更加深入。氢键对于维持生物体分子结构和生物化学反应起着重要作用。在维持蛋白质二级、三级结构空间结构上,氢键起着举足轻重的作用,氢键的形成让繁大的蛋白质分子拥有极为复杂的空间立体结构。氢键对稳定蛋白质的空间结构具有重要作用,一旦氢键被破坏,蛋白质的空间结构将发生改变,其生理功能就会丧失。在生物大分子核酸DNA和RNA中,不同的核苷酸通过两组或三组氢键的作用使五种碱基形成特异的配对关系,从而将生物体的遗传信息储存在生物体内。氢键作用,广泛存在生物体生化反应中,分子识别,参与遗传信息在细胞内的表达,促成并控制代谢过程提供了可能。可以说,氢键是维持生物体系结构的重要作用力之一。深入揭示氢键形成的机制对于生物体系的研究,分子设计和药物设计等前沿学科都会产生重要的影响。 1.2氢键的本质 对于氢键的本质,一般都认为主要是静电作用。在X—H?Y中,X-H是强极性共价键,由于X的电负性很大,吸引电子能力强,使氢原子变成一个几乎没有电子云的“裸露”的质子而带部分正电荷,带正电的氢质子与电负性很强的Y存在强弱的的作用。氢质子的半径特别小,电场强度很大,又无内层电子,可以允许另一个带有部分负电荷的Y原子(电负性大,半径小且有孤对电子的原子)充分接近它,从而产生强烈的静电作用而形成氢键。氢键的键长比共价键的键长长的多,作用力比化学键弱的多,比范德华力稍强,它的键能在10.40kJ/mol范围内。氢键与范德华力不同之处是氢键具有饱和性和方向性。氢键的方向性是指以H原子为中心的3个原子X,H,Y夹角尽可能小。当它们尽可能在一条直线上时,X原子与Y原子间的距离就会较远,斥力较小,形成的氢键稳定。所谓氢键的饱和性是指H原子形成1个共价键后,通常只能再形成1个氢键。这是因为H原子比X、Y原子小得多,当形成X—H?Y键以后,在第二个Y原子再靠近H原子时,将会受到已形成氢键的Y原子电子云的强烈排斥而展示出其饱和性。因此,氢键通常被看作是较强的、具有有方向性和饱和性的范德华力。氢键的键能与X、Y原子的电负性极其原子半径有关。X、Y原子的电负性越大,半径越小,它们与氢原子所形成的氢键的键能越大。在周期表中,只有F、O、N三个元素的原子可以和氢原子形成较强的氢键。F原子的电负性最大,与氢原子形成的氢键最强。从理论上说F—H…F之间的氢键作用力最强,键能最大。以F—H?F是最强的氢键,其它氢键键能强弱顺序是O—H?O,O—H?N,N—H?N,Cl的电负性虽颇大,但因为它的原子半径也大,所以形成的氢键O—H?Cl较弱。Jeffrey按照氢键的键能把氢键分为强氢键、中等强度的氢键和弱氢键。 1.3氢键的类型 按照氢键的发展史,通时根据质子受体的范围发展,将氢键分为两类。一类是常规氢键,另一类是非常规氢键。 1.3.1常规氢键 常规氢键X—H…Y是在一个质子供体和一个质子受体间形成,质子供体和受体多局限于像N,O,F等这些原子半径小、电负性大的原子,质子受体Y且有一对或一对以上的孤对电子。 1.3.2非常规氢键 随着对氢键的不断研究,氢键的范围不断扩大,

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