红松4个组织的转录组数据分析与次生代谢产物的表达.pdfVIP

林业科学研究　２０１５，２８（４）：５９７ ６０３ ＦｏｒｅｓｔＲｅｓｅａｒｃｈ 　　文章编号：１００１１４９８（２０１５）０４０５９７０７ 红松４个组织的转录组数据分析与次生代谢 产物的表达差异初探  张　振，张含国 ，周　宇，张　磊，于宏影，张　莉 （东北林业大学 林木遗传育种国家重点实验室，黑龙江 哈尔滨　１５００４０） 关键词：红松；转录组；基因注释；次生代谢途径 中图分类号：Ｓ７９１．２４５ 文献标识码：Ａ ＤｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌＧｅｎｅＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎＡｎａｌｙｓｉｓｏｎＳｅｃｏｎｄａｒｙＭｅｔａｂｏｌｉｔｅｓａｎｄ ＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅＳｅｑｕｅｎｃｉｎｇｔｏＦｏｕｒＴｉｓｓｕｅｓｏｆＰｉｎｕｓｋｏｒａｉｅｎｓｉｓ ＺＨＡＮＧＺｈｅｎ，ＺＨＡＮＧＨａｎｇｕｏ，ＺＨＯＵＹｕ，ＺＨＡＮＧＬｅｉ，ＹＵＨｏｎｇｙｉｎｇ，ＺＨＡＮＧＬｉ （ＳｔａｔｅＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＦｏｒｅｓｔＧｅｎｅｔｉｃｓａｎｄＴｒｅｅＢｒｅｅｄｉｎｇ，ＮｏｒｔｈｅａｓｔＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｈａｒｂｉｎ　１５００４０，Ｈｅｉｌｏｎｇｊｉａｎｇ，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＴｈｉｓｒｅｓｅａｒｃｈｃｏｍｐａｒｅｄｔｈｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｓｏｆｆｏｕｒｄｉｆｆｅｒｅｎｔｔｉｓｓｕｅｓｏｆＰｉｎｕｓｋｏｒａｉｅｎｓｉｓｂｙｕｓｉｎｇＲＮＡｓｅｑ ｔｅｃｈｎｉｑｕｅａｎｄａｌｏｔｏｆｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙｅｘｐｒｅｓｓｅｄｕｎｉｇｅｎｅｓｗｅｒｅｏｂｔａｉｎｅｄ．Ａｔｏｔａｌｏｆ２１．３ＧＢｏｆｄａｔａｗａｓｏｂｔａｉｎｅｄａｎｄ ４１４７６ｅｘｐｒｅｓｓｅｄｕｎｉｇｅｎｅｓｗｅｒｅｒｅｃｅｉｖｅｄａｆｔｅｒａｓｓｅｍｂｌｉｎｇ．ＴｈｒｏｕｇｈＧＯａｎｄＣＯＧｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ，ｔｈｅｃｏｍｍｅｎｔｅｄａｎｄ ｔｒａｎｓｃｒｉｂｅｄｓｅｑｕｅｎｃｅｓｗｅｒｅｃｌａｓｓｉｆｉｅｄｉｎｔｏ２４ｏｒ５６ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｃａｔｅｇｏｒｉｅｓ，ｗｈｉｃｈｒｅｆｅｒｒｅｄｔｏｍａｎｙｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌｐｒｏｃｅｓ ｓｅｓｓｕｃｈａｓｍａｔｅｒｉａｌａｎｄｅｎｅｒｇｙｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ，ｓｉｇｎａｌｔｒａｎｓｄｕｃｔｉｏｎ，ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌｒｅｇｕｌａｔｉｏｎａｎｄｄｅｆｅｎｓｅｒｅａｃｔｉｏｎ． Ｔｈｒｏｕｇｈｐａｔｈｗａｙｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔａｎａｌｙｓｉｓ，ｔｈｅｐａｔｈｗａｙｓａｓｓｏｃｉａｔｅｄｗｉｔｈｇｒｅａｓｅｓｙｎｔｈｅｔｉｃｆａｔｔｙａｃｉｄｂｉｏｓｙｎｔｈｅｔｉｃａｎｄｔｅｒ ｐｅｎｏｉｄｓｓｙｎｔｈｅｓｉｓｗｅｒｅｆｏｕｎｄ．ＴｗｏｕｎｉｇｅｎｅｓｏｆｍｅｔａｂｏｌｉｃｐａｔｈｗａｙｓｉｎＫＥＧＧｄａｔａｂａｓｅｗｅｒｅｃｏｍｐａｒｅｄａｎｄ１６ｋｅｙ ｅｎｚｙｍｅｇｅｎｅｓｏｆｆａｔｔｙａｃｉｄｓｙｎｔｈｅｓｉｓｉｎｏｔｈｅｒｓｐｅｃｉｅｓｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓａｎｄ３４ｋｅｙｅｎｚｙｍｅｇｅｎｅｓｏｆｔｅｒｐｅｎｏｉｄｂｉｏｓｙｎｔｈｅｔｉｃ ｐａｔｈｗａｙｗｅｒｅｏｂｔａｉｎｅｄ．Ｂｙｈｉｇｈｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇａｎｄｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｒｅｓｅａｒｃｈ，ａｌａｒｇｅｎｕｍｂｅｒｏｆＰｉｎｕｓｋｏ ｒａｉｅｎｓｉｓｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｕｎｉｇｅｎｅｓｗａｓｏｂｔａｉｎｅｄ．Ｔｈｉｓｒｅｓｅａｒｃｈｐｒｏｖｉｄｅｓｒｅｆｅｒｅｎｃｅｓｆｏｒｔｈｅｒｅｓｅａｒｃｈｏｎｔｈｅｇｅｎｅｓｒｅｌａｔｅｄ ｔｏｓｅｃｏｎｄａｒｙｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓｓｙｎｔｈｅｓｉｓｉｎＰｉｎｕｓｋｏｒａｉｅｎｓｉｓ． Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：Ｐｉｎｕｓｋｏｒａｉｅｎｓｉｓ；ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ；ｇｅｎｅａｎｎｏｔａｔｉｏｎ；ｓｅｃｏｎｄａｒｙｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ 红松（ＰｉｎｕｓＫｏｒａｉｅｎｓｉｓ）为松科松属乔木，主要分 量的粗蛋白，油脂，多糖，粗纤维，除此之外，还富含 布在中国东北东部，俄罗斯远东南部及朝鲜半岛，日 维生素、矿物质以及钙、磷、锰、钻、铜、锌等微量元 本岛也有零星分布。红松是中国 级重点保护野生