进化树分析方法.doc

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系统进化树分析方法: FYI: 1.首先要确定代表株:为啥选那些作为代表,一般是选择经典的,有文献参考的或者地域或年份等特定特征 2.找出整个树的root 3.由根溯源,你的研究株在树中处于什么地位,与哪些株进化距离最近 4.统筹分析整个树,你选择哪部分片段构建的树,为什么这样选择,作出这样的树能揭示怎样的进化规律 5. 有没有相关文献资料以及实验结论对你的分析结果作支撑 mega进化树有两个作用: ① 判断进化地位,你不要把图做成后边都是对齐的,根本看不出进化地位,越靠右越近代; ② 分支表示的是亲缘关系,离得越远亲缘关系越低,彼此靠近的二者基本可以认定为同种(如果blast出来后发现二者的同源性非常高的话),而它们之间的那个数值表示的是这个同源性的可靠程度多高。越高表示二者的亲缘关系(也就是同种)越可信。一般要>95才能表示是同种,66以上可以表示亚种或者变种之类的。 你老师做的这个图根本就不标准,很多信息都没出来,没法分析,我上面说的两点是进化树中最重要的分析内容,你的图上全都没显示,如何分析?

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kongbaipan
该用户很懒,什么也没介绍

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