几种拟南芥突变体鉴定方法.pdf

HY5‐215  The Arabidopsis HY5 gene encodes a bZIP protein that regulates stimulus‐induced development  of root and hypocotyl, Genes Dev. 1997 Nov 15; 11(22): 2983–2995.  In the genome of hy5‐215, the splicing acceptor site of the first intron (=G) was replaced by A,  suggesting that this mutation causes aberrant RNA processing    In hy5‐215, the nucleotide g‐1117 (white letter), which is the last nucleotide in the first intron, is  replaced by an a  HY5‐215 的突变位点与野生型相比，并没有酶切位点的变化。引物在有一个错配位点的情 况下，可以产生一个新的酶切位点PsiI，从而将野生型、杂合、纯合进行区分。  Design proper primers and choose proper  a enzyme by dCAPS Finder 2.0  (/dcaps/dcaps.html)    HY5proF GAGAGAATATGCGAGTGAATGAC Len 22 TM 54 HY5proR TCTAAAGTCTCTTTTATGTTTTATA Len 25 TM 50.8 PsiI:     但是，实验室并没有PsiI，所以只能再去寻找新的内切酶。在设计的引物有2 个错配位点 时，可以产生新的酶切位点，AluI 将野生型切断。  HY5-215 F CGTATCTCCTCATCGCTTTCAATAG Len 25 TM 60.0 HY5-215 R GTCCCGCTCTTTTCCTCTTTATC Len 23 TM 60.8 AluI:            MYCT  The Arabidopsis bHLH Transcription Factors MYC3 and MYC4 Are Targets of JAZ Repressors and  Act Additively with MYC2 in the Activation of Jasmonate Responses, Plant Cell. 2011 Feb; 23(2):  701–715.                      MYC2  Mutagen : T‐DNA insertion    Insertion Flanking  TAAAACCGCCGGAGAATCAGATCACTCCGATCTAGAAGCT