水稻抗病基因Lrr19类似物序列分析报告研究.pdf

实用标准 水稻抗病基因 Lrr19 类似物序列分析研究 摘要 根据 genebank 数据库中已知水稻抗病基因 lrr19 类似物序 列，设计引物，比较普通野生稻、粳稻和籼稻的基因序列，初步分 析了 3 种水稻 lrr19 类似物的序列差异，与小麦抗病基因 lrr19 编 码序列的同源性。结果发现在水稻不同品系间发生部分位点碱基的 变化，相似性为 97%～98%；水稻中该类似物编码的蛋白质与小麦的 lrr19 有较高的同源性（ 54%～55%），籼稻、粳稻和普通野生稻编码 蛋白都在相同的位置存在 nb-arc 和 lrr 结构域，并且与小麦 lrr19 蛋白相似。推测水稻 lrr19 基因类似物是抗性相关基因，并且在水 稻不同品种间序列差异不大，相对较为保守。 关键词 水稻；抗病基因； lrr19 ；类似物 中图分类号 s511 文献标识码 a 文章编号 1007-5739 （2013） 15-0013-03 自 1992年第 1 个植物抗病基因 hm1被克隆 [1] 以来，人们不断发 现已克隆的抗病基因存在一些相似的结构域，如 nbs、lrr 、tir 、 stk 、lz 、cc 等 [2-5] 。1996年 kanazin 和 yu 开展了使用这些结构 域设计简并引物从基因组 dna 中进行扩增的研究 [6-7] 。由于扩增 的产物与抗病基因有较高的同源性，一些研究者将其分别称为抗性 基因同源类似物 resistance gene analog （rga ）[6] 。 亮氨酸富集重复序列（ lrr ）是长度在 24 个氨基酸之内的多重重 复，它含有多个亮氨酸或其他亲水残基，也含有有分配规律的脯氨 酸和天冬氨酸。 lrr 存在于许多功能不同的蛋白质中，它与蛋白质 文案大全 实用标准 之间的相互作用及信号转导有着非常密切的关系。人们还发现在抗 病基因 rps2 、rpm1和 n 的 lrr 结构域中单个氨基酸的变化可导致 抗病反应的消失和减弱 [7] ，而且如果单独在水稻中表达 xa21 蛋白 的 lrr ，也可表现出对水稻白叶枯病菌的部分抗性 [8] 。这些研究表 明 lrr 结构中微小的修饰就容易破坏 lrr 的功能，表明 lrr 在植物 抗病过程中具有重要作用 [9] 。lrr19 是一个小麦抗白粉病相关基 因，其编码蛋白的分子功能是与 atp 非共价键结合并选择性相互作 用，是一种普遍的重要的辅酶和酶调节因子 [10] ，其功能与蛋白激 酶有关 [11] 。2003 年， kikuchi 等从粳稻品种日本晴中克隆出小麦 抗病基因 lrr19 的类似物 [12] 。目前，对水稻抗病基因类似物 lrr19 结构和功能的研究鲜见报道。 通过比较普通野生稻（ oryzarufipogon griff. ）、粳稻 （japo-nica ）和籼稻（indica ）3 种水稻的 lrr19 基因序列，初步 分析这 3 种水稻品系在分化上的关系。同时将这 3 个品种的水稻 lrr19 类似物分别与已发表的小麦抗病基因