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大肠杆菌对土壤微生物群落组成与修改 摘要：这个实验研究了缩影生存模式的三个大肠杆菌株 (起源于土,狗粪和人类排 泄物)对土壤微生物群落组成与修改。密度逐步增加 (0.05%、0.15%、0.30%和 0.50%)的胆汁盐 3 号 (BS3)被添加到砂壤土壤中。实验室培养的大肠杆菌被灌输 进土壤并孵化 150天来监控他们的生存模式。通过对土壤中 BS3 的检测来判断细 菌群落的多样性。该方法是通过两个栽培和培养为基础的独立的方法。一般来说, 孵化 10天和 90 天，逐步增加 BS3 浓度都会导致 CFU 计数的减少。DGGE 分析表 明只要轻微改变细菌群落组成需 10天,但一个明显的变化需 90 天。生存的大肠 杆菌在土壤中显著影响微生物群落的多样性,因为大肠杆菌的死亡速率逐渐下降 该土壤中微生物群落多样性也减少。生存的大肠杆菌对不同土壤微生物群落中的 多样性都有重要影响,因此结合预测模型对水质管理和微生物源跟踪研究有重要 意义。 关键词：胆汁盐 3 号 ; 大肠杆菌 ; 微生物群落结构 ； 土壤 ;生 1 引言 土壤和水体是大肠杆菌的主要来源。起源于农业的大肠杆菌进入土壤通 过应用动物肥料或直接沉积或通过放牧牲畜沉淀。土壤绑定大肠杆菌通过雨 水径流转入水系统,因此大肠杆菌也影响水的质量。生存的大肠杆菌在土壤中, 一个关键问题当考虑到周围的水域污染的风险,是不很好地确定由于缺乏信 息的主要影响因素的土壤。非生物因素,如温度、湿度（ [Byappanahalli和 Fujioka,2004],[Byappanahalli et al。,2006],[Desmarais et al。2002])、 土壤质地 (Desmarais et al。,2002 年)、有机物质含量(泰特,1978),和粪肥 介质,已经被证明能够影响生存的大肠杆菌在土壤中,尽管这些因素如何影响 大肠杆菌还不清楚。一些生物因素,如捕食,也被报告影响大肠杆菌在土壤中 的持久性 (Brettar 和 Hofle,1992)。理解其他生物因素的影响,例如,土壤微 生物群落组成,但是,仍然是很有限的 ([Bogosian et al。1996]和 [Korhonen 和 Martikainen,1991])。 生存或持久性的大肠杆菌引入土壤后土壤微生物的群落结构改变 ([Colwell,1997],[McGradySteed et al。1997]、 [纳伊 ·姆和李,1997]和 [Tilman et al。,1997])。一个逆关系之间被发现的存活率铜绿假单胞菌和 复杂的小麦根际微生物多样性 (Matos et al。,2005)。在另一项研究在人为 构造的缩影,invasibility Ralstonia 青枯病菌的生化变种被发现逆相关程 度的土壤微生物群落多样性 (Irikiin et al。 ,2006)。Van Elsas(Van Elsas et al。,2007年)表明,生存的大肠杆菌是负面影响土壤微生物的复杂 性社区。大肠杆菌物种基因多样化 (Dykhuizen,1984),它已被证明,致病菌株 的大肠大肠杆菌存活不同于非株 ([Fenlon et al。2000]、[这里 et al。2000] 和 [奥格登 et al。,2001])。因此要推广环境行为不当的致病菌株其他大肠 杆菌种群。 作为一个选择性抑制剂,胆汁盐# 3(BS3)广泛应用于微生物培养基浓 度,0.15%支持增长的革兰氏阴性细菌肠。BS3 已经应用于土壤微观研究降低 土壤细菌的数量,进而推动本土生长的自然大肠杆菌数量 (Byappanahalli和 Fujioka,2004)。在这项研究中 BS3 是用于构建微观与梯度的土壤微生物群落 结构,和那些被用作模型微观土壤生态系统与不同的微生物群落结构来确定 生存的接种大肠大肠杆菌菌株。这是假设应用程序在不同浓度的 BS3 土壤会 导致逐渐改良土壤微生物群落组成,这将影响生存的反向接种过的大肠杆菌。 1．材料和方法 总结了实验方案在这项研究中的应用，如图 1所示。详细的实验设置如 下: 图 1 2.土壤取样和治疗 收集的沙质