动力学模拟gromacs概要.ppt

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2020-07-16 发布于福建
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动力学模拟实验选题背景: 材料:凝集素样氧化型低密度脂蛋白受体 1(LX-1) sLOX-1是LOⅩ-1的可溶形式,其水平与 LOX-1的表达水平相关,在急性冠脉综合症等心血管疾病、高血压、高脂血症的早期诊断中具有重要价值两条链的序列 >gpdb 1 YPUA Chain A, Human Oxidized Low Density Lipoprotein Receptor LOX-1 C2 Space GroupRVANCSAPCPQDWIWHGENCYLFSSGSFNWEK SQEKCLSLDAKLLKINSTADLDFIQQAISYSSFPFWMGL SRRNPSYPWLWEDGSPLMPHLFRVRGAVSQTYPSGT CAYIQRGAVYAENCILAAFSICQKKANL >gpdb 1YPUB Chain B, Human Oxidized Low Density Lipoprotein Receptor LOX-1 C2 Space GroupRVANCSAPCPQDWIWHGENCYLFSSGSFNWEK SQEKCLSLDAKLLKINSTADLDFIQQAISYSSFPFWMGL SRRNPSYPWLWEDGSPLMPHLFRVRGAVSQTYPSGT CAYIQRGAVYAENCILAAFSICQKKANL 结构特征 LOⅩ-1蛋白是分子量为50kDa的Ⅱ型穿膜糖蛋,由273个氨基酸组成,属于清道夫受体家族。LOX-蛋白由包含34个残基的N末胞质区域、单个穿膜区域、由82个残基组成的颈部紧接着的由130个残基组成的C型凝集素样配体合区域的C末端胞外部分组成 ●ovMD19 openGL Display