细菌基因提取裂解液.pdf

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核酸的提取与纯化 一 DNA 的提取与纯化 (一) 实验目的与主要原理 DNA 存在于细胞核中。通过裂解组织与细胞,使细胞膜破 碎,暴露出 DNA 与蛋白质的混合物。此时,通过蛋白酶的消化, 使 DNA 与蛋白质进行分离,而后利用硅胶柱或者酚:氯仿法,去 除蛋白质,从而提取高纯度 DNA。 (二) 实验材料 蛋 白 质 K ( 20mg/ml) ,裂 解 液 ( 100mmol/l Tris(pH 8.0),500mmol/L EDTA(pH 8.0),20mmol/l NaCl,10% SDS),硅胶柱, TE ( 10mmol/l Tris-HCl,1mmol/L EDTA(pH 8.0),0.5*TAE (20mmol/l Tris- 乙 酸 , 0.5mmol/l EDTA,pH 8.0),10*Loading buffer(50mmol/l EDTA,60%甘油,0.25%溴酚蓝,pH 7.0) 。 (三) 实验方法 DNA 提取的方法目前主要有两种,一种是利用酚:氯仿抽提的方 法,另一种是利用硅胶柱吸附的方法。其中酚:氯仿抽提法由于试剂具 有较强的腐蚀性和毒性,且对环境污染较大, 目前使用者较少。而硅胶 柱的方法操作比较简单,且毒性很低,对环境的影响较少,故而被广 大实验者所使用。目前硅胶柱的生产厂家较多,以沉淀方法较为多见, 主要步骤如下。 1 样本前处理 哺乳 物细胞:提前准备 55℃冰浴。 (1) 对于贴壁细胞,用胰蛋白酶或其他方法收集细胞, 对于悬浮细胞,直接收集细胞。用 PBS 洗 3 次。 (2) 加入 3 倍体积的裂解液,加入蛋白液 K 终浓度达 到 500ug/ml,37℃孵育 4~6 小时。 物组织:提前准备 55℃,70℃水浴。 (1) 将 25mg 物组织切碎,置于一无菌的 1.5ml 离 心管中(注意,尽量越碎越好)。 (2) 加入 150~200ul 的裂解液(含 500ug/ml 的蛋白酶 K),55℃孵育直至完全裂解,(因组织不同而异,鼠尾 6~8h,可以过夜裂解,每小时颠倒 2~3 次)。 (3) 如果需要去除RNA,可以加入适量Rnase A 于样 品中,室温孵育 2min。 (4) 12000r 离心 5min,转移上清于一无菌的离心管。 2 DNA 提取过程 (1) 利用 2 倍体积无水乙醇和 1/10 体积的 3mmol/L 醋酸钠沉淀 DNA (注意沉淀为 DNA,不能弃去) (2) 将上述混合物加入硅胶柱中,12000r 离心 1min, 后用 75%的乙醇清洗杂质,洗 2~3 次。 (3) 将硅胶吸附柱置于干净的离心管中,在柱的中央 加入 200ul 预热 TE (60℃),或去离子水(pH)7.0),室温静 置 1min,12000r 离心 1min,洗脱DNA。洗脱出的DNA置 于-20℃保存。     3 琼脂糖凝胶 电泳 (1)1%琼脂糖的配制:例如:0.15g 琼脂 糖+15ml 0.5*TAE 微波炉加热至沸腾,待降低至 70℃ 加入 Gold view 染料(5ug/100ml),倒入小型胶槽中(其 他规模胶槽按此比例配制)。室温静置 40min。 (2)取 50~100ng DNA,用去离子水补充体积至 10ul,

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