非编码RNA的研究进展.pptVIP

Noncoding RNA 的 研究进展报告 生科院 彭瀚辉 2013.11.29 Noncoding RNA 1. 2. 5. 4. 3. Introduction Classification Research progress of ncRNA The relationship with major disease Future Introduction ? 非编码 RNA ( ncRNA) 存 在于绝大多数生物体中， 是一类不编码蛋白质的 RNA 分子 ，随着基因组测 序等相关技术的进步与发 展 ， 越来越多的 ncRNA 及其生物学功能被揭示出 来 ， ncRNA 在发育、代谢 和疾病等生命活动中都起 着重要 的作用。 在哺乳动物基因组中 mRNA 只占全部 转录本的 2 ％ , 其余 98 ％为非编码 RNA 27 2 46 25 UTRs ORFs Repetitive sequence Regulatory elements RNA genes Classification 以长度划分 小于 50nt: microRNA ， siRNA ， piRNA 等。 50 — 500nt: rRNA ， tRNAsnRNA ， snoRNA ， SLRNA ， SRPRNA 等。 大于 500nt:mRNA-like noncoding RNA 等。 非编码 RNA 短链非 编码 RNA 长链非 编码 RNA ? microRNA ：微 RNA ，长度约 22nt ，与基因表达、细 胞周期以及个体发育过程调控领域起着超乎预料的 重要的作用。 ? siRNA ：内源性 siRNA ，最早被发现于果蝇 ，其长 度为 21bp ，是一种与微 RNA 大小相似的双链 RNA 分 子，它在 RNA 干扰 (RNAi) 途径中介导序列专一 mRNA 的降解。 ? piRNA ： piRNA 的名称来自其与 Piwi 蛋白密切相关 ，长度 是 3 个小 RNA 分子中最长的 ，约为 24-31n t ，具有抑制可移 动的基因扩增 和移位 ，及维持基 因组稳定性方面等功能 . 短链非编码 RNA 长链非编码 RNA （ 50 — 500nt ） ? rRNA 和 tRNA ? snRNA ：小核 RNA(smallnuclearRNA) ，它是真核生物转录后 加工过程中 RNA 剪接体（ spliceosome ）的主要成分，参与 mRNA 前体的加工过程。 ? snoRNA ：核仁小分子 RNA ，参与 rRNA 的加工，并指导 rRNA 上特异位点的甲基化或假尿嘧啶化。 ? SLRNA ：反式剪切引导 RNA （ trans-splicing leader RNA ） ，反式剪切是真核生物 mRNA 成熟的过程之一。反式剪切过 程包括剪切引导 SLRNA 以及 mRNA 的转录和连接过程。 SRPRNA ：信号识别颗粒 (signalrecognition particle SRP)RNA ，是 SRP 的组成部分，与细胞内蛋白质的运转有关。 长链非编码 RNA （大于 500nt ） ? mRNA-like noncoding RNA ：类 mRNA RNA ，是一类3′端有 PolyA ，无典型 ORF ，不编 码蛋白质的 RNA 分子，与细胞的生长和分化 、胚胎的发育、肿瘤的形成和抑制密切相关 的调节子。 Research progress of NcRNA ncRNA 的研究技术进展 ncRNA 研究工 作 大规模 的鉴定 新的非 编码 RNA 通过各 种新方 法研 究非编 码 RNA 的功能 理论 预测 实验 发现 借助计算机，从已有的 非编码 RNA 中提取特征 信息，然后以特征信息 做全基因组搜索 简 便 快 捷 以理论预测为目标进行 大量的相关实验以发现 全新的 ncRNA 相 辅 相 成 准 确 可 靠 构建非编 码 RNA 的 cDNA 文库 构建高密 度的覆盖 全基因组 的芯片 RNomics 基因芯片 简单快捷，工作量小，可以 检测到大量低丰度的非编码 RNA 对仪器要求较高，成本也很 高 操作简单，成本很低 不能准确的确定转录起始终 止位点，也很难区分剪切加 工产物 Rnomics 罗氏 454 基因组测序仪 Solexa 高通量测序仪 RNomics 的核心在于构建非编码 RNA 的 cDNA 文库，可以直接测序，这种方法简单快 捷，工作量小，可以检测到大量低丰度的非编 码 RNA ，但是对仪器要求较高，成本也很高， 目前使用的测序仪主要有 454 和 solexa 两种。 而传统的克隆测序，工作量很大，且对低丰 度的非编码 RNA 检测效率较差，但是这种方法 操作流