分子生物学 基因表达调控.docx

基因表达调控 作者：Violax 概念 基因组（genome）：生物体所有遗传物质的总和 基因：合成有功能的蛋白质、RNA所必需的全部DNA顺序，包括转录调控区、结构基因 旁侧序列（flanking sequence）：位于转录区前后，并与其相邻的DNA序列，是基因的调控区 编码序列（coding sequence）：编码一段蛋白产物的序列 基因表达：基因转录及翻译的过程，生成蛋白质、rRNA和tRNA 协同表达（coordinate expression）：在一定机制控制下，功能上相关的一组基因，无论其表达方式为何，均需协调一致，共同表达 基因表达的时间特异性：按功能需要某一特定基因的表达严格按照特定的时间顺序发生 基因表达的空间特异性（细胞特异性/组织特异性）：个体生长过程中一种基因产物在个体的不同组织和器官中表达不同 基因表达调控：在接受或适应环境的过程中，在基因表达水平上做出应答的分子机制 基因表达谱（gene expression profile）：构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库 管家基因（housekeeping gene）：其基因表达产物对生命的全过程都是必不可少的 诱导（induction）：某信号刺激下可诱导基因在特定环境中表达增强的过程 阻遏（repression）：某信号刺激下可阻遏基因在特定环境中表达产物水平降低的过程 调节蛋白：原核生物中可以分为特异因子（决定RNA聚合酶对启动序列的特异性识别、结合能力），阻遏蛋白，激活蛋白。诱导、阻遏调节引起的基因表达通过影响调节蛋白（产生/变构），直接/间接影响RNA聚合酶活性 乳糖操纵子（lac operon）：表达利用分解乳糖的一组酶 色氨酸操纵子（Trp operon）：编码色氨酸的元件之一 单顺反子：真核生物基因转录产物为单顺反子，即一条mRNA模板只含有一个翻译起始点和一个终止点 顺式作用元件（cis-acting factors）：可影响自身基因表达活性的DNA序列 启动子（promoter）：启动转录的一段DNA序列 增强子（enhancer）：远离转录起始点，决定基因的时间、空间特异性表达，增强启动子转录活性的DNA序列 沉默子：真核生物细胞中能阻遏启动子转录作用的顺式作用元件 诱导多能干细胞（induced pluripotent stem cell，iPS） 反应元件：顺式作用元件的一种，能对特定信号作出反应，与特异性蛋白因子结合后可调节一类基因转录活性，实质为DNA序列 反式作用因子（反式作用蛋白，trans-acting factors）：与特异的顺式作用元件作用，反式激活另一基因转录 顺式作用蛋白：可特异性识别、结合自身基因的调节序列，调节自身基因的开启或关闭 转录因子（transcription factor，TF）：真核生物钟与RNA聚合酶共同作用形成转录起始复合体启动转录 非编码RNA（lncRNA）：不编码蛋白质的RNA 小发夹RNA（shRNA） 反义RNA（antisense RNA）：与mRNA互补后抑制与疾病发生直接相关基因表达的RNA miRNA：真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA 小干扰RNA（siRNA） 环形RNA（circ RNA） 单体型（monomer） 二聚体（dimer） 多聚体（polymer） 基因表达 特点： 组成性表达——管家基因表达之手启动子与RNA聚合酶相互作用的影响 适应性表达——通过诱导和阻遏的基本手段使生物体适应环境 协调表达——在一定机制控制下，功能相关的有一组基因，无论其表达方式为何种，需协调一致、共同表达，使生物体适应环境、维持细胞分化及个体发育 原核生物基因表达调控 调控三要素：特异DNA序列；调节蛋白；RNA聚合酶 多级调控：基因水平（基因丢失、扩增、重排、DNA甲基化）；转录起始（基因表达基本控制点）、转录后加工、转运；翻译起始、翻译后加工、蛋白质降解 转录起始调控机制： σ因子对应不同的启动子，更换σ关闭前一套基因表达，开启后一套基因表达 操纵子模型由编码序列、启动序列、操纵序列、其他调节序列串联组成（或由结构基因、调控序列、调节基因组成） 特别地： 启动序列特定区域内有一些相似序列，如原核生物-10区的TATA盒，-35区的TTGACA 启动序列——影响与RNA聚合酶的亲和力 操纵序列——结合阻遏蛋白负性调节 其他调节序列——结合激活蛋白 如CAP位点 正性调节 重点：乳糖操纵子、色氨酸操纵子 乳糖操纵子 E.coli有葡萄糖和乳糖时，优先利用葡萄糖；没有葡萄糖和乳糖时，优先利用乳糖 利用乳糖的酶有： β-半乳糖苷酶（Z编码，分解乳糖为半乳糖、葡萄糖） 透酶（Y编码，使乳糖进入细胞中） 乙酰基转移酶（A编码，转