人类染色体图像核型分析系统的研究与实现.pdf

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人类染色体图像核型分析系统的研究与实现 摘 要 染色体是真核细胞生物在细胞分裂时期的遗传物质形成的特定形态,是遗传 信息的载体,染色体主要由DNA 和蛋白质组成,具有存储和传递遗传信息的作 用。染色体核型是指一个细胞中的全部染色体按其大小和形状特征顺序排列所构 成的图像,染色体核型分析是遗传分析技术的经典方法,是生物遗传科学研究和 医学遗传疾病诊断的重要手段之一。 早期的人类染色体核型分析需要具备专业技能的人员手动完成,对操作人员 素质要求较高,且费时费力,分析效率较低,无法满足科学研究以及疾病诊断的 需求。近年来随着计算机技术的更新,数字图像处理理论以及模式识别理论的发 展,人们利用计算机辅助染色体核型分析得以实现,大大提高了染色体核型分析 效率,为生物学及医学领域的发展带来了便利。本文基于 G 显带染色体图像, 运用数字图像处理理论以及模式识别技术设计算法功能模块,结合计算机程序设 计方法开发一套完整的染色体图像核型分析软件系统,实现计算机辅助核型分析。 本文结合理论分析以及实验数据,在染色体图像预处理阶段,设计了以大津 法图像分割、形态学平滑、形态学边界提取为主要流程的图像预处理方法。以染 色体的长度、着丝点位置、带纹分布作为染色体图像主要特征数据,特征数据提 取过程中,对于染色体图像中轴线的提取,设计了通过计算染色体距离变换图像 中不同梯度方向上灰度极大值的方法来提取染色体骨架点;在着丝点定位过程中, 提出了染色体中轴线各点的垂线与轮廓截线长度来表示染色体宽度,并计算宽度 最小值确定着丝点的位置;在带纹量化时,统计垂直中轴线方向上的灰度均值来 量化带纹分布。 根据人类染色体核型特征以及染色体分组依据,利用提取的染色体特征数据, 设计以BP 神经网络初步分组再用k 均值聚类法进行组内分类的二级分类模型。 最后借助OpenCV 库以及Qt 界面框架等软件工具,整合本文的方法流程,设计 并实现人类染色体图像分类软件系统。经过实验数据验证,该系统取得了较好的 自动分类率以及自动分类准确率。 关键词: 染色体核型,特征提取,BP 神经网络,k 均值聚类 I 人类染色体图像核型分析系统的研究与实现 Abstract Chromosome is a specific form formed by the genetic material of eukaryote during division and the carrier of genetic information, which is mainly composed of DNA and protein. It has the function of storing and transmitting genetic information. Karyotype refers to an image formed by arranging all chromosomes in a cell according to their size and shape characteristics. Karyotype analysis is a classical method of genetic analysis technology, and is one of the important means of biological genetic science research and medical genetic disease diagnosis. The early human chromosome karyotype analysis needs to be done manually by people with professional skills, which requires high quality of operators, time-consuming, laborious and inefficient, and can not me

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