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1.于Eppendorf 离心管中加入 10×PCR缓冲液 5μl(1×) MgCl2 2~10μl(1~5mM) 引物 适量(0.1~1μM) 标记/非标记dNTP 5μl (200μM,dTTP:Dig-dUTP=3:1) ddH2O 加到50μl 模板DNA 1~100ng Tag DNA多聚酶 0.2~1μl(1~5units) 步骤 PCR扩增标记法 反应组 对照组1 对照组2 DNA模板 + + - Dig-dUTP + - - 2.混合后PCR仪扩增 循环 温度 时间 1 94°C 5’ 94°C 45’ 2~31 55+0.2°C 45’ 72°C 90’ 32 72°C 5’ 33 4°C Hold 步骤 PCR扩增标记法 杂交组织化学-探针 末端标记法:用于短链DNA或寡核苷酸探针标记 40个以上碱基检测较稳定 敏感性较低 分3端标记法和5端标记法 3 端标记法: 原理:DIG-11-ddUTP在末端脱氧核苷酸转移酶作用下 与寡核苷酸的3端相连 杂交组织化学-探针 5端标记法: 原理:寡核苷酸5端少一个磷酸基,T4噬菌体多核 苷酸激酶将[γ-32P]ATP的γ-32 P转移到5端 杂交组织化学-探针 RNA体外合成/标记法: 用以合成并同时标记RNA探针 产量高,NTP浓度要求低, 不用纯化 原理: 将模板DNA(双链) 插入带有噬菌体RNA pol启动子的特定质粒,在体外RNA多聚酶的作用下,以DNA为模板、启动子为起点, 合成带有标记核苷酸的RNA探针。 杂交组织化学-探针 RNA体外合成/标记法 pGEM 1.??? 于Eppendorf离心管中加入 DNA模板(酶切成线性) 1μg 含噬菌体启动子的质粒 NTP标记混合物 2μl 含10mM ATP, 10mM CTP 10mM GTP,6.5mM UTP 3.5mM DIG-11-UTP 10×反应缓冲液 2μl DEPC处理的H2O 加至 17μl RNA体外合成/标记法 步骤 2.混合后加:RNase抑制剂 1μl RNA多聚酶(SP6/T7) 2μl ?3.柔和混合后37℃保温2h ?4.加入DNase Ⅰ2μl,37℃15(去除模板DNA) ? 5.加入2μl 200mM pH8.0 EDTA ? 6.加入2.5μl 4M LiCl和75μl预冷乙醇 ? 7.混合后置-70℃,30或-20℃过夜 ? 8.4℃13000g离心15,弃上清 ? 9.加100μl 70%乙醇(预冷)洗,离心弃上清 ? 10.真空干燥,加100μl DEPC-H2O溶解,-20℃保存 RNA体外合成/标记法 步骤 杂交组织化学-探针 化学修饰法:常用的有光敏生物素、磺化 可用以标记单/双链DNA或RNA 光敏生物素标记:光敏生物素(叠氮基团)+核酸───标记探针 磺化标记:亚硫酸氢钠和甲
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