烟草行业烟草DNA文库构建及重要基因表达谱研究项目评标情况.pdfVIP

烟草行业烟草 DNA 文库构建及重 要基因表达谱研究项目评标情况 附件 9 “烟草 cDNA 文库构建及重要基因表达谱研究”项目评 标情况 壹、招标要求 1 ．项目意义 建立烟草 cDNA 文库，获得大量的EST 和全长 cDNA 序列是开 展烟草功能基因研究的重要前提，是实施烟草基因组计划重大专 项的基础性工作，将为烟草分子育种奠定基础。今年针对 “烟草 cDNA 文库构建及重要基因表达谱研究”项目进行招标攻关，壹是 先期开展相关技术研究，为全面启动烟草基因组计划重大专项积 累必要的技术、人才基础，二是通过项目招标，引导行业内外科 研院所加大烟草遗传育种基础研究力度，推动烟草育种工程的顺 利实施。 目前美国、欧盟等先后开展了不同烟草品种的EST 测序，且 已获得了壹定数量的烟草EST 数据，但我国在烟草重要功能基因 表达调控、代谢网络等分子水平的基础仍相当薄弱。因此，充分 利用我国的种质资源，建立不同种质在逆境诱导、不同发育时期 以及不同组织器官的 cDNA 文库，分离克隆和烟草生长、发育、 抗逆、抗病、品质等有关基因的全长序列、调控因子以及特异启 动子，研究其表达模式，进行基因表达产物分析、转基因功能验 证及生理遗传学分析，对于确定基因功能，进而分析这些基因在 烟草遗传改良中的利用价值和途径具有重要意义。 2 ．研究内容 （1）烟草cDNA 文库的构建及测序。构建普通烟草不同组织、 不同时期的全长 cDNA 文库；构建逆境诱导的特异组织的全长 cDNA 文库；构建特定烟草品种（品系）特定组织的全长 cDNA 文 库；挑选克隆且进行测序。 （2 ）基因挖掘和生物信息学分析。对测序数据进行拼接， 对非重复全长 cDNA 序列进行功能注释和功能分类及代谢网络分 析；建立烟草不同时期的基因表达谱以及全长 cDNA 序列的检索 和比对数据库。 （3）重要功能基因研究。利用生物信息学分析得到的相关 基因的表达谱信息，鉴定重要的功能基因且开展关键基因的详细 表达谱研究和功能分析。 3 ．经济技术指标 （1）完成覆盖烟草重要发育时期根、茎、叶、花等不同组 织器官和特殊烟草种质特异组织的全长 cDNA 文库 30 个左右。通 过全长文库构建、全长克隆完全测序和数据拼接等，分离鉴定烟 草的全长 cDNA 序列 2 万条左右。 （2）建立烟草基因表达、检索及分析的基础数据库。 （3）分离和烟草香气、烟碱和有害物质代谢作用网络以及 氮磷钾营养高效、抗病、抗旱、耐盐碱等性状相关的基因及调控 因子300 个之上，其中鉴定关键基因 5 个之上，同时进壹步分析 表达谱且验证其功能，获得 5 个之上重要基因功能验证的烟草材 料。 本项目的创新点在于，壹是建立壹批覆盖烟草重要发育时期、 不同组织器官和特殊烟草种质的全长 cDNA 文库，建成国际上规 模最大、种类最多的烟草 cDNA 文库，且测序获得基因全长序列； 二是分析基因表达特征谱，探索在特定材料、特定时期、特定组 织活跃表达且起重要作用的基因，以确定重点研究分析且具有应 用前景的烟草功能基因，将使我国在烟草功能基因组研究领域在 国际上占有壹席之地。 本项目的关键技术在于，壹是通过全长 cDNA 文库的构建及 均壹化，获得高质量的全长 cDNA ；二是通过烟草表达基因数据库 的开发，建成比较完善的烟草基因相关信息的检索平台；三是分 离和烟草品质、营养性状相关的基因，且进行功能验证。 二、应标情况 标书 综合 评标 应标单位 评标结论 序号 评估分 排序 主标单位：中国农业科学院烟草研究所 中标 1 参标单位：西南大学 89.7 1