梅花鹿鹿茸产量相关SNP的开发与验证.pdfVIP

摘 要 本研究利用质谱SNP 分型技术对梅花鹿产茸性状的候选变异位点进行检测，并与之进行关联 分析，以期挖掘到影响梅花鹿鹿茸产量的有效分子标记，为梅花鹿早期选种提供科学依据。研究 结果如下： 1、本研究以四平梅花鹿和东大梅花鹿两个群体为研究对象，对其产茸性能进行分析，结果 表明：四平梅花鹿群体 1~9 锯三杈鲜茸平均单产为3.79±1.28 kg ，三杈鲜茸最高平均单产为5.11 2 ±2.27 kg ；1~7 锯三杈鲜茸重与年龄呈正线性相关，线性方程为y=0.72x+0.36 （n=105 ，R =0.96 ， P0.01 ）；最佳生茸年龄范围为4~9 锯，最佳生茸年龄为7 锯。东大梅花鹿群体 1~7 锯三杈鲜茸 平均单产为4.84±1.4 kg ，三杈鲜茸最高平均单产为6.12±2.19 kg ；1~6 锯三杈鲜茸重与年龄呈正 2 线性相关，线性方程为y=0.77x+1.95 （n=70 ，R =0.99 ，P0.01 ）；最佳生茸年龄范围为2~7 锯， 最佳生茸年龄为6 锯。 2 、运用质谱SNP 分型技术，对四平和东大两个群体共265 只梅花鹿的94 个与产茸性状显著 相关的候选SNP 位点进行分型检测，结果表明：71 个SNP 位点分型成功，其中66 个位点具有 多态性，利用66 个SNP 位点对梅花鹿群体的遗传多样性进行评估，结果显示：有38 个低度多态 性位点，28 个中度多态性位点，无高度多态性位点，多态信息含量（PIC ）平均值为0.22 ；观测 杂合度（Ho ）平均值为0.26，期望杂合度（He ）平均值为 0.27 ；有效等位基因数（Ne ）平均值 为1.8，接近实际检测等位基因数2 。综合上述指标表明所选梅花鹿群体遗传多样性低。 3、运用一般线性模型对SNP 位点与梅花鹿产茸性状进行关联分析，结果表明66 个SNP 位 点中有7 个位点与产茸性状显著相关（P 0.05 ），位点SNP1427_255498 （CG ）、SNP324_21192 43 （CT ）、SNP307_1564879 （CT ）、SNP123_784899 （CT ）、SNP219_9123735 （CT ）、SNP 2027_42481 （AG ）、SNP614_2586055 （AG ）在产茸性能方面的优势基因型依次为CC、CC、 CC、TT、TT、GG、AA 。对7 个显著SNP 位点所在位置及最近基因功能分析，发现位点SNP14 27_255498 位于BSPRY 基因上游区，其余6 个位点均位于内含子区域，进一步分析BSPRY 基因 的功能，发现其可能参与调节成骨细胞生成及软骨钙化。 4 、采用SNPs 位点基因型组合的方法，将3 个位点（SNP307_1564879、SNP614_2586055、 SNP2027_42481）基因型进行组合，并对不同类型基因型组合个体平均产茸量进行方差分析，发 现 GGAACC 基因型组合个体平均产茸量为4.91±2.13 kg ，显著高于其它基因型组合个体的平均 产茸量（P0.05 ）。表明所选梅花鹿群体，在产茸性能方面GGAACC 为优势基因型组合。 5、为进一步确定GGAACC 基因型组合能否作为未来选择高产茸量梅花鹿个体的有效分子标 记，从不同鹿场随机采集 100 只梅花鹿公鹿血样组成验证群体，利用质谱 SNP 分型技术对 100 只梅花鹿 3 个位点（SNP2027_42481、SNP614_2586055、SNP307_1564879）进行分型检测，并 对不同类型基因型组合个体平均产茸量进行方差分析，结果表明：GGAACC 基因型组合个体平 均产茸量为6.51±1.42 kg ，显著高于其它基因型组合个体的平均产茸量（P0.05 ）。 综上所述，GGAACC 基因型组合可以作为未来选择高产茸量梅花鹿的分子标记。 关键词：梅花鹿，产茸性状，质谱SNP 分型，关联性，基因型组合 I