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筛选多肽
试剂及配制
LB 培养基:
胰蛋白胨 10g
酵母提取物 5g NaCl 5g
溶于去离子水,至 1L,高压灭菌, 4℃保存。
IPTG/Xgal :
称取 1.25g IPTG ,1.0g Xgal ,溶于二甲基甲酰胺,至总体积 25ml , -20℃避光保存。
LB/IPTG/Xgal 平板:
1L LB 培养基 +15g 琼脂粉,高压灭菌,冷却至 70℃以下,加入 1ml IPTG/Xgal , 立即铺板, 4℃避光保存。
顶层琼脂糖凝胶:
胰蛋白胨 10g
酵母提取物 5g NaCl 5g
MgCl 2.6H 2O 1g
琼脂糖 7g
溶于适量去离子水中,至总体积为 1L 。高压灭菌,分装为 50ml/ 份,室温保存,使用时于微波炉内融化。
(5) 2× M9 盐:
Na2HPO 4 12g
KH 2PO4 6g
NaCl 1g
NH 4Cl 2g
溶于适量去离子水中,至终体积为 1L 。
小型平板:
500ml 2× M9 盐
500ml 3%琼脂粉
20ml 20%葡萄糖2ml 1M MgSO 4
0.1ml 1M CaCl 2
1ml 硫胺素( 10mg/ml )
在混合之前,将上述成分分别高压灭菌并冷却至 70℃以下,葡萄糖和硫胺素采用过滤除菌。平板储存于 4℃。
封闭缓冲液:
0.1M NaHCO3(PH 8.6)
5mg/ml BSA
0.02% NaN 3
过滤除菌,储存于 4℃。
TBS:
50mM Tris-HCl (PH 7.5)
150mM NaCl
高压灭菌,室温储存。
PEG/NaCl :
20%( w/v )聚乙二醇 -8000
2.5M NaCl
高压灭菌,室温储存。
碘化物缓冲液:
10mM Tris-HCl (PH 8.0)
1mM EDTA
4M NaI
室温避光保存。
操作步骤:
第一天
( 1) 以 0.1M NaHCO3(PH 8.6) 制备 100 μg/ml 的靶分子溶液。如果需要稳定靶分子,可以用含有金属离子的相似离子强度缓冲液。
( 2) 在每孔内加入 1.5ml 靶分子溶液,重复涡旋直至表面完全湿润(这一步要多注意,尽量避免溶液形成液珠) 。
( 3) 在湿盒中, 4℃温和振荡孵育过夜。 4℃保存于湿盒中备用。
第二天
( 4)将 ER2537(滴度测定时用来铺板的细菌培养物)接种至 10ml LB 培养基中。如果是在同一天扩增洗脱的噬菌体,也可以将 ER2537 过夜培养物接种于含有 20ml LB 培养基的250ml 锥形瓶中(比例为 1:100)。37℃剧烈振摇。
( 5)将平皿反扣在洁净的纸巾上,去除包被液,加满封闭液, 4℃孵育至少 1h。
( 6)去除包被液。用 TBST( TBS+0.1%Tween-20)快速洗涤 6 次。反复旋转确保孔底及 孔侧面都被洗涤。 按照步骤 5 的方法去除洗涤液 (也可利用自动洗板机洗涤) 。洗涤要迅速, 避免平皿干燥。 (注意每次更换纸巾,以避免交叉污染) 。
( 7)用 1ml TBST 稀释 4×1010 噬菌体( 10μ l 原库),加至包被后的平皿内,室温下轻
缓摇动 10-60min 。
( 8)以步骤 5 的方法去除未结合的噬菌体。
( 9)以步骤 6 的方法用 TBST洗涤板子 10 次,每次换用洁净的纸巾,避免交叉污染。
( 10)用 1ml 的洗脱缓冲液洗脱结合的噬菌体。洗脱液可以是含有配体( 0.1-1mM)的TBS,或是含有靶蛋白 ( 100μ g/ml )的 TBS以和固化在平皿上的靶蛋白竞争结合噬菌体。 室温下轻缓摇动 10-60min 。将洗脱液转入微量离心管中。
( 10a)或使用通用缓冲液, 0.2M 甘氨酸 - 盐酸( PH2.2), 1mg/ml BSA。轻缓摇动不超过 10min ,将洗脱液转入微量离心管中,以 150μl 1M Tris-HCl(PH 9.1) 中和。
( 11)取小量洗脱液( 1μ l )测定滴度,如果有必要,可将第一轮或第二轮测定滴度的噬斑进行测序(见后续操作) 。(未用的洗脱物可 4℃保存过夜,第二天进行扩增。在这种情
况下,用 LB 过夜培养 ER2537,第二天,用 LB 培养基以 1:100 将该培养物稀释至 20ml ,加入未扩增的洗脱液,在 250ml 的锥形瓶内, 37℃剧烈振摇孵育 4.5h ,进入步骤 13)。
( 12)将剩余的洗脱物进行扩增:将洗脱物加入 20ml ER2537 培养物中(对数早期) ,
37℃剧烈振摇孵育 4.5h 。
( 13)将培养物转入微量离心管中, 4℃,10000 转离心 10min,将上清转入新的离心管中,再次离心。
( 14)将 80%的上清转入新的离心管中,加入 1/6 体积的
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