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肽键及其形成 二肽.三肽:根据成肽的氨基酸数目命名. 寡肽:10肽以下称之。 多肽: 10肽以上称之。 氨基酸残基:氨基酸成肽后已不完整,故称之。 肽单位:与肽键相连的六个原子(C?1,C,O,N,H,C ? 2)组成的肽平面。 在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排列,这种排列顺序称为氨基酸顺序 通常在多肽链的一端含有一个游离的?-氨基,称为氨基端或N末端;在另一端含有一个游离的?-羧基,称为羧基端或C末端。 氨基酸的顺序是从N-端的氨基酸残基开始,以C-端氨基酸残基为终点的排列顺序。如上述五肽可表示为: Ser-Val-Tyr-Asp-Gln 2.命名 书写:用AA的三字母符号来表示,AA间通过“-”连接,N端写在左侧,也有用AA的单字符号表示书写,之间不用“-”分隔 如上述五肽可表示为:Ser-Val-Tyr-Asp-Gln;或SVYDQ 命名:由肽链的N端AA残基开始,称为某氨酰某氨酰……某氨基酸 如上述五肽可命名为:丝氨酰缬氨酰酪氨酰天冬氨酰谷氨酰胺 如方向由C N则需标出两端中的一端 肽的表示法: 按氨基酸的顺序依次读为某氨酰某氨酰……某氨酸。 如:谷氨酰半胱氨酰甘氨酸. 简称:谷胱甘肽 简式:Glu·Cys·Gly AA之间重要的另外一种连接方式-二硫键 3. 肽键 的特点 4. 肽的物理和化学性质 5. 天然存在的重要多肽 谷胱甘肽的作用: 破坏内源性过氧化物和自由基(抗氧化) 去除外源性化合物的毒性(解毒) 维护蛋白质活性中心中的巯基的稳定 参与AA的跨膜运输 乙二醛酶的辅酶 参与二硫化物的转化 催产素和加压素 相同点: 结构相似:都有环式结构,都为9肽 产生部位和运输相同:都为下丘脑的神经细胞合成,与运载蛋白结合后经轴突到垂体后叶贮存并释放到血液 不同点: 结构有差异:第3位和8位AA残基不同 功能不同: 催产素:使子宫和乳腺的平滑肌收缩,有催产及排乳功能,并促进遗忘; 加压素:使血管平滑肌收缩,增加血压,减少排尿,故又叫抗利尿素;并增强记忆 脑肽 第四节 蛋白质的结构 一 蛋白质的分子大小 二 蛋白质的结构层次 三 蛋白质的三维结构 一 蛋白质的分子大小 蛋白质是分子量很大的生物分子:6000—1000000 Dr R1 R2 R3 R4 Rn H2NCHCONHCHCONHCHCONHCHCO………NHCHCOOH 肽链,氨基酸残基 N—末端:含有自由氨基的一端,书写用H表示; C—末端:含有自由羧基的一端,书写用OH表示; H.Tyr.Gly.Gly.Phe.Met.OH(甲硫氨酸型脑啡肽) H.Tyr.Gly.Gly.Phe.Leu.OH(亮氨酸型脑啡肽) 一级结构是研究高级结构的基础。 可以从分子水平阐明蛋白质的结构与功能的关系。 可以为生物进化理论提供依据。 可以为人工合成蛋白质提供参考顺序。 蛋白质顺序测定基本方法路线 测定蛋白质分子中多肽链的数目. 拆分蛋白质分子中的多肽链. 断裂链内二硫键. 测定多肽链的氨基酸组成. 分析多肽链的N末端和C末端. 多肽链部分裂解成肽段. 测定各个肽段的氨基酸顺序. 片段重叠法重建完整多肽链一级结构 确定多肽链中二硫键的位置. ① 测定蛋白质分子中多肽链的数目 二硫键的断裂 ④测定每条多肽链的氨基酸组成,并计算出氨基酸成分的分子比; ⑤分析多肽链的N-末端和C-末端 ★末端氨基酸的测定:多肽链末端氨基酸分为两类,N-端氨基酸和C-端氨基酸。在肽链氨基酸顺序分析中,最重要的是N-端氨基酸分析法。末端氨基酸测定的主要方法有: 氨肽酶法:氨肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链的N-端逐个的向里水解。根据不同的反应时间测出酶水解所释放出的氨基酸种类和数量,按反应时间和氨基酸残基释放量作动力学曲线,从而知道蛋白质的N-末端残基顺序。最常用的氨肽酶是亮氨酸氨肽酶,水解以亮氨酸残基为N-末端的肽键速度最大。 羧肽酶法:羧肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链的C-端逐个的水解。根据不同的反应时间测出酶水解所释放出的氨基酸种类和数量,从而知道蛋白质的C-末端残基顺序。目前常用的羧肽酶有四种:A,B,C和Y;A和B来自胰脏;C来自柑桔叶;Y来自面包酵母。羧肽酶A能水解除Pro,Arg和Lys以外的所有C-末端氨基酸残基;B只能水解Arg和Lys为C-末端残基的肽键。 ⑥多肽链断裂成多个肽段 可采用两种或多种不同的断裂方法将多肽样品断
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