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引物设计SUM
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页脚内客
页脚内客7
退火温度与%值
①在%值允许范用内,选择较髙的复性温度可大大减少引物和模板间的非特异性结合, 提高込反应的特异性。复性时间一般为%?必这,足以使引物与模板之间完全结合。 ②引物的复性温度可通过以下公式帮助选择合适的温度:
%值(解链温度)=4(护?乜(卅F复性温度=%值-(5?QC)
③%对于设立妙7退火温度是必需的。在理想状态下,退火温度足够低,以保证引物同 目的序列有效退火,同时还要足够高,以减少非特异性结合。合理的退火温度从%。C到70 J 退火温度一般设左比引物的%低S°C。
④引物退火温度
退火温度决泄込特异性与产量,温度高特异性强,但过髙则引物不能与模板牢固结合, 羽“扩增效率下降,温度低产量高,但过低可造成引物与模板错配,非特异性产物增加。一 般先由M7°C反应条件开始,设置一系列对照反应,以确左某一特左反应的最适退火温度。 也可根据引物的$+0%含量进行推测,把握试验的起始点,一般试验中退火温度现 如坷憑讪比扩增引物的融解温度认血叫如他也⑹低北,可按公式进行计算:
% = % - 5°C= “矽十彳十 2(^+y)-rc
其中〃 7.彳,E分別表示相应碱基的个数。例如,%个碱基的引物,如果$十彳%含量 为时,则久的起点可设在於C。在典型的引物浓度时(如0?即剧“退火反应数秒即可 完成,长时间退火没有必要。
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