实习2-真核生物基因结构的预测分析.pptVIP

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实习二 真核生物基因结构的预测分析;实习一;精品资料; 你怎么称呼老师? 如果老师最后没有总结一节课的重点的难点,你是否会认为老师的教学方法需要改进? 你所经历的课堂,是讲座式还是讨论式? 教师的教鞭 “不怕太阳晒,也不怕那风雨狂,只怕先生骂我笨,没有学问无颜见爹娘 ……” “太阳当空照,花儿对我笑,小鸟说早早早……”;基因组序列cDNA序列;真核生物基因的主要结构;基因结构分析;开放阅读框的识别;基因开放阅读框/基因结构分析识别工具;ORF识别:GENSCAN;*;*;ORF识别: GenomeScan;GenomeScan输出结果:文本;GenomeScan输出结果:图形;课堂练习;转录调控序列分析 CpG岛、启动子和转录终止信号区域的预测;CpG岛的预测;CpG Island 分析常用软件;提交序列文件;;启动子区结构;PromoterScan;启动子预测:PromoterScan;PromoterScan输出结果;转录终止信号;转录终止信号预测:POLYAH;;课堂练习;基因密码子偏好性;;基因密码子偏好性: CodonW;参 数 选 择;;课堂练习;内含子/外显子剪接位点识别;;剪接位点识别:NetGene2;NetGene2输出结果;mRNA剪接位点识别:Spidey;Spidey同源序列的获得:序列比对;;Spidey输出结果;GENSCAN与Spidey结果比较;课堂练习;选择性剪接(Alternative splicing)分析;选择性剪接的类型;查询选择性剪接相关的网站;选择性剪接查询:ASTD数据库;ASTD数据库检索结果:基因描述信息 ;ASTD数据库检索结果:选择性剪接的mRNA;ASTD数据库检索结果:表达的组织特异性;基因结构分析;实习一;Thanks!;

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