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§2.7 酶的作用机理及实例; 仅仅是靠近还不够,还需要酶和底物的反应基团在反应中彼此相互严格地定向,即酶活性中心的催化基团(氨基酸残基上的基团)定向于底物的反应基团。只有既靠近又定向,底物分子才能迅速的形成过渡态,加速反应的进行。; 2.底物变形(distortion)与电子张力(electron strain) 酶与底物结合后,底物发生变形,底物由基态变为激发态,降低了活化能,使酶促反应加速。 ;3.共价催化(covalent catalysis); 酶分子上的亲核基团有Ser-OH、Cys-SH、His-咪唑基等,这些富含电子的基团(有孤对电子),攻击底物分子中电子云密度较小的亲电子基团,并供出电子,二者形成共价键,酶和底物形成一个不稳定的中间物,进而转变为产物。;4. 酸碱催化 (acid-base catalysis);广义酸基团(质子供体);5.微环境效应;二.溶 菌 酶 (lysozyme);1.底物、溶菌酶及酶和底物复合物的结构;溶菌酶的最适小分子底物; 溶菌酶的结构 ;鸡蛋蛋清溶菌酶的氨基酸序列; 溶菌酶和底物结合的空间构象;溶菌酶----底物复合物;2. 催化作用机理 溶菌酶底物与酶活性中心的关系 溶菌酶活性中心上的Asp52氧原子距离底物敏感键(C-O键)中碳原子(D糖环氧原子)只有0.3nm,活性中心上另一个氨基酸 Glu35的羧基距离底物敏感键(C-O键)中氧原子也只有0.3nm,溶菌酶的活性中心的氨基酸残基与底物敏感键既靠近又定向。;; 底物D糖环构象发生变化 ; 酶与底物结合后,D 糖环构象发生变形,从正常的能量较低的椅式构象变为能量较高的半椅式构象。;Glu;Glu;3. 溶菌酶催化特点小结;(二)胰 凝 乳 蛋 白 酶 (chymotrypsin);催化机理: ; His57作为质子的受体从Ser195吸取一个质子,形成共价键,使Ser195-O-成为很强的亲核试剂,攻击底物羰基碳原子,二者形成共价键。;第二步;底物的C-N键断裂;底物C-N键氮端产物释放;第五步;第六步;第七步;第八步;胰凝乳蛋白酶催化机制的特点: ; 胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、弹性蛋白酶为消化酶,在胰腺中合成,以非活性的酶原形式分泌到消化道,在消化道中转化成有活性的酶。; 胰凝乳蛋白酶的口袋底部有一个小的Ser,口袋上方有两个小的Gly残基,有利于较大的芳香族氨基酸侧链进??,因此胰凝乳蛋白酶催化芳香族氨基酸形成的肽键。 ; 弹性蛋白酶有一个浅的口袋, 口袋上方有大的Thr和Val残基,只允许小分子的氨基酸像甘氨酸、丙氨酸进入,因此弹性蛋白酶可催化甘氨酸和丙氨酸羧基形成的肽键。 ;一. 胰蛋白酶原的激活 ;二. 胰凝乳蛋白酶原的激活 ;三、几种蛋白酶的激活及它们之间的相互作用 ;§2.7 寡聚酶、同功酶、诱导酶、固定化酶 ;三、诱导酶 ;四、固定化酶 ;自己看的内容; G o H o m e

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