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SectionRNA结构与功能多样性;基因组转录物; 真核细胞内RNA的种类及分布;种类;二、RNA折叠(RNA folding);;;1。tRNA :呈三叶草形(个别二叶草);携带氨基酸;? tRNA的三级结构:呈倒L形;原核生物 rRNA: 23S, 16S, 5S
? 5S rRNA:位于大亚基上,无稀有碱基, 可与tRNA
和蛋白质相互识别和作用
? 16S rRNA:位于核糖体小亚基上,与mRNA结合
? 23S rRNA:位于核糖体大亚基上,是核酶,催化
肽键的生成
真核生物 rRNA:修饰核苷较多
大亚基:28S,5.8S,5S,
小亚基:18S
rRNA二级结构呈三叶形,是核糖体的骨架;大肠杆菌16S rRNA的二级结构; 5S rRNA二级结构;5′;mRNA(信使RNA,messenger RNA) : 约占5%
mRNA在真核生物中的初级产物称为hnRNA。;Pre-mRNA由于存在内含子,因此其二级结构在成熟过程中是变化的。
Pre-mRNA的内含子剪切,需要顺式作用元件(包括5’和3’剪切位点,以及分支点序列)和反式作用因子的相互作用。
5’和3’剪切位点在内含子通常是保守的5’-GU…AG-3’,若其一发生变化,则激活相邻的GU或AG,引发选择性剪切。
分支点一般位于3’-剪切点上游50nt范围内,酵母中分支点序列为:UACUAAC(其中倒数第三个A为分支点)
反式作用因子包括U系列snRNA与蛋白质组成的snRNP,以及U2AF、hnRNP、IBP等参与剪切和调控。 ; 内含子剪切位点与RNA二级结构的关系; 人弹性蛋白的外显子和内含子结构:;mRNA和与其编码的蛋白质在空间结构上存在着令人惊奇的对应关系,说明核酸传递的遗传信息不仅是线性一维的,还存在空间三维信息的对应传递。
以人的前尿激酶(human prourakinase)分子为例:
mRNA三级结构转弯区,同样对应于蛋白质的转弯区;
?-螺旋最强或中等形成者都位于mRNA二级结构的茎区;
?-折叠中的两条肽链,其mRNA编码序列一个位于环区,另一个一定位于茎区,并且一级序列相距可能很远,但在mRNA三级结构中彼此靠近。; 人前尿激素酶mRNA结构 ; 根据mRNA与蛋白空间结构关系绘制的人前尿激酶的空间结构图:;4 具有催化功能的RNA 内含子结构:;;;5。其它小分子RNA:;4.2 snoRNA:核仁小RNA;三 RNA功能多样性:;(一)tmRNA:;1。tmRNA的结构;;2。tmRNA作用??型:反式翻译模型,Karzai 等提出;细菌中蛋白质如在转录过程中由于某种蛋白质因子结合在某基因的操纵子区域而影响了转录子的完整性,或是转录子在转录后加工过程中被不恰当地切断,都有可能使在翻译中的mRNA序列缺失终止密码子。
当核糖体移动到不完整的mRNA的3’端时,核糖体不能与mRNA脱离,P位的不完整蛋白质亦不能及时释放。此时,3’携有Ala的tmRNA在一系列蛋白因子的帮助下,识别滞留的核糖体,并进入核糖体的A位,通过转肽反应,将丙氨酸同滞留在P位的蛋白质相连接,随后tmRNA进入P位,核糖体将从mRNA脱离下来,转而结合到tmRNA的mRNA区域,并以mRNA区域为模板,沿着刚翻译的多肽C末端继续翻译其编码的一段10aa的信号肽,由ORF提供终止密码子。
该信号肽的氨基酸序列在细菌中高度保守,为AANDENYALAA,可被水解蛋白识别,从而使融合蛋白被水解。;;;3。与tmRNA作用有关的蛋白因子:;;4。tmRNA 生物学意义;;(二)反义RNA: ;2。性质和意义:;3。作用方式举例:渗透压调节中的micRNA;;(二) 微小RNA(microRNA,miRNA): ;2。miRNA的生物学特征:;3。miRNA的发生和成熟过程:; miRNA成熟过程中的要素:;4。miRNA的效应过程:;4.1 miRISC的组装:; RISC复合体主要成分在不同生物物种中有较大的出入:;;;;4.2 miRNA的成熟和效应途径; 不同的AGO蛋白与miRNA或siRNA组装成为两类RISC:;(三)RNA干扰 : ; 尽管随着研究的深入,siRNA与miRNA的界限也来越不明显,但还是存在诸多不同。目前有人认为,miRNA可能是siRNA的进化形式。;; miRNA和siRNA的不同作用途径;RNAi 的作用机制 ;3。细胞核内RNAi途径:;3.2 RNAi和异染色质形成:;3.3 RNAi和DNA切除:; 嗜热四膜虫微核?巨核的新核发育过程中伴随着种系DNA序列(内部切除片段,internal e
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